Bazarlab

🧬 ژنتیک و ژنومیک هیبریداسیون؛ وقتی مرز میان گونه‌ها نفوذپذیر می‌شود. قسمت نخست هیبریداسیون (Hybridization) یکی از فرایندهای مهم در تکامل است که در آن افراد متعلق به جمعیت‌ها یا گونه‌های ژنتیکی متمایز با یکدیگر آمیزش کرده و فرزندان دورگه تولید می‌کنند. برخلاف دیدگاه کلاسیک که گونه‌ها را واحدهایی کاملاً مجزا و دارای مرزهای ژنتیکی نفوذناپذیر در نظر می‌گرفت، مطالعات ژنومیک نشان داده‌اند که مرزهای گونه‌ای در بسیاری از سیستم‌های زیستی نسبی، پویا و تا حدی نفوذپذیر هستند. در واقع، تکامل الزاماً یک فرایند کاملاً درختی نیست؛ در بسیاری از موارد، تاریخچه ژنوم‌ها شبکه‌ای از واگرایی، نوترکیبی، جریان ژنی و هیبریداسیون را نشان می‌دهد. 🧬 هیبریداسیون دقیقاً چیست؟ هیبریداسیون را می‌توان به‌صورت آمیزش میان جمعیت‌هایی تعریف کرد که از نظر ژنتیکی متمایز هستند. اگر هیبریدها زنده بمانند و قادر به تولیدمثل باشند، ژن‌های یک تبار می‌توانند از طریق جریان ژنی (Gene flow) وارد خزانه ژنی تبار دیگر شوند. در صورت تداوم آمیزش و Backcrossing، بخشی از آلل‌های یک جمعیت می‌تواند به‌صورت پایدار در ژنوم جمعیت دیگر باقی بماند. این فرایند هیبریداسیون درون‌گرا یا Introgressive Hybridization نام دارد. به بیان ساده: Hybridization → Recombination → Backcrossing → Introgression و در نهایت، ژنومی حاصل می‌شود که ترکیبی از تاریخچه‌های ژنتیکی چند تبار را در خود جای داده است. 🌳 چرا هیبریداسیون برای تکامل اهمیت دارد؟ یکی از مهم‌ترین پیامدهای هیبریداسیون، ایجاد ترکیبات ژنتیکی جدید است. جهش‌های جدید تنها منبع تنوع ژنتیکی نیستند؛ هیبریداسیون می‌تواند تنوع ژنتیکی موجود در دو جمعیت متفاوت را در یک پس‌زمینه ژنومی جدید با یکدیگر ترکیب کند. این موضوع از دیدگاه تکاملی اهمیت زیادی دارد، زیرا یک آلل مفید که در یک گونه یا جمعیت تکامل یافته است، ممکن است از طریق Introgression وارد جمعیت دیگری شود و در محیط جدید تحت انتخاب طبیعی قرار گیرد. بنابراین، هیبریداسیون می‌تواند نه‌تنها باعث کاهش تمایز ژنتیکی شود، بلکه در شرایط خاص به‌عنوان منبعی برای نوآوری تکاملی و سازگاری نیز عمل کند. 🧩 ژنوم هیبرید چه چیزی به ما می‌گوید؟ در یک هیبرید، همه بخش‌های ژنوم الزاماً به یک اندازه از والدین مختلف منشأ نمی‌گیرند. به دلیل تفاوت در: 🔹 نرخ نوترکیبی 🔹 انتخاب طبیعی 🔹 انتخاب علیه هیبریدها 🔹 ساختار کروموزومی 🔹 عدم سازگاری ژنتیکی 🔹 اندازه و ساختار جمعیت 🔹 و تاریخچه جمعیتی ممکن است برخی نواحی ژنوم به‌شدت از یک گونه منشأ گرفته باشند، در حالی که نواحی دیگر نشان‌دهندهٔ تبار مشترک یا جریان ژنی از گونهٔ دیگر باشند. در نتیجه، ژنوم یک موجود هیبریدی را می‌توان به‌صورت موزاییکی از قطعات با تاریخچه‌های تکاملی متفاوت در نظر گرفت. این یکی از دلایلی است که چرا داده‌های Genome-wide نسبت به بررسی تعداد محدودی از مارکرهای ژنتیکی، تصویر بسیار دقیق‌تری از هیبریداسیون ارائه می‌کنند. 🧬 ژنومیک چگونه هیبریداسیون را آشکار می‌کند؟ توسعه فناوری‌های توالی‌یابی نسل جدید (NGS) و Whole-genome sequencing امکان بررسی هزاران تا میلیون‌ها جایگاه ژنتیکی را فراهم کرده است. در مطالعات ژنومیک هیبریداسیون، پژوهشگران می‌توانند الگوهایی مانند موارد زیر را بررسی کنند: 📌 SNPs و واریانت‌های ژنتیکی 📌 Population structure 📌 Genomic ancestry 📌 Allele frequency 📌 Linkage disequilibrium 📌 Phylogenetic discordance 📌 Patterns of introgression 📌 Genomic regions of high differentiation با ترکیب این داده‌ها با مدل‌های جمعیت‌شناختی و تکاملی، می‌توان پرسش‌هایی مانند موارد زیر را بررسی کرد: آیا دو جمعیت واقعاً از یکدیگر جدا بوده‌اند؟ هیبریداسیون چه زمانی رخ داده است؟ جریان ژنی در چه جهتی بوده است؟ چه مقدار از ژنوم تحت تأثیر Introgression قرار گرفته است؟ کدام بخش‌های ژنوم در برابر ورود ژن‌های خارجی مقاوم مانده‌اند؟ و آیا ژن‌های واردشده تحت انتخاب طبیعی قرار گرفته‌اند؟ 🧬 همه ژن‌ها به یک اندازه Introgress نمی‌شوند یکی از یافته‌های مهم ژنومیک تکاملی این است که جریان ژنی در سراسر ژنوم یکنواخت نیست. برخی نواحی ژنوم ممکن است به‌راحتی میان گونه‌ها جابه‌جا شوند، در حالی که برخی مناطق به دلیل انتخاب طبیعی یا عدم سازگاری ژنتیکی، در برابر Introgression مقاومت نشان دهند. به همین دلیل، در ژنوم دو گونه نزدیک می‌توان الگوهای متفاوتی مشاهده کرد: ناحیه A → واگرایی کم ناحیه B → واگرایی متوسط ناحیه C → واگرایی بسیار زیاد این ناهمگونی ژنومی اطلاعات مهمی دربارهٔ نیروهایی که در شکل‌گیری و حفظ مرزهای گونه‌ای نقش دارند، فراهم می‌کند. #تکامل @bazaarlab

🔬 Hybridization | Genetics & Genomics 🧬 🧬 When the boundaries between species emerged در سه مجموعه پستی که در ادامه خواهند آمد، خواهیم دید که فرآیندهای تکاملی و ژنتیک چگونه در تغییر چهره‌ی گونه‌ها با هم همکاری می‌کنند. 🧬🧬 با ما همراه باشید 🤝 گردآورنده: SDA @bazaarlab 🔗 #تکامل 🧬

#موجودی سلام وقت بخیر تریپسین, پنی سیلین استرپتومایسین و قرص PBS موجود است. @mohammadshy

پژوهشگران دانشگاه استنفورد با بهره‌گیری از هوش مصنوعی 🤖، پیشرفت چشمگیری در مهندسی ژنتیک و طراحی ویروس‌های باکتریوفاژ برای هدف قرار دادن باکتری اشریشیا کلی (E. coli) 🦠 به دست آورده‌اند. این دستاورد علمی که توسط تیمی از دانشمندان کامپیوتر و زیست‌شناسی محقق شده، نشان‌دهنده گذار پارادایمی از روش‌های سنتی آزمایشگاهی به رویکردهای مبتنی بر یادگیری ماشین در بیوتکنولوژی است 🧬. در این مطالعه، الگوریتم‌های هوش مصنوعی برای پیش‌بینی ساختار پروتئینی فاژها و بهینه‌سازی تعامل آن‌ها با گیرنده‌های سطحی باکتری‌ها به کار گرفته شدند. نتایج حاکی از آن است که مدل‌های تولیدی قادر به طراحی فاژهایی با اختصاصیت بالا بوده که می‌توانند به طور موثر باکتری‌های پاتوژن را شناسایی و نابود کنند، بدون اینکه به میکروبیوم سالم آسیب برسانند 🛡️. این فناوری پتانسیل بالایی در مقابله با مقاومت آنتی‌بیوتیکی دارد، زیرا فاژها به عنوان درمان‌های جایگزین و هدفمند عمل می‌کنند 💊. استفاده از هوش مصنوعی نه تنها زمان کشف و توسعه چنین درمان‌هایی را به شدت کاهش داده، بلکه دقت مهندسی پروتئین‌های فاژی را نیز افزایش داده است. این پژوهش نشان می‌دهد که تلفیق علوم داده و زیست‌شناسی سیستم‌ها می‌تواند راهکارهای نوینی برای مبارزه با عفونت‌های باکتریایی مقاوم فراهم آورد 📊. با این حال، چالش‌های ایمنی، اخلاقی و نظارتی همچنان نیازمند توجه جدی جامعه علمی و سیاست‌گذاران است ⚖️. این دستاورد گامی بزرگ به سمت پزشکی دقیق و شخصی‌سازی شده در برابر بیماری‌های عفونی محسوب می‌شود و آینده‌ای روشن برای درمان‌های نوین بیولوژیک ترسیم می‌کند ✨ گردآورنده: SDA @bazaarlab منبع: https://news.stanford.edu/stories/2026/08/evo-2-ai-tool-e-coli-killer-bacteriophages

پژوهش‌های نوین نشان می‌دهد باکتری Salmonella غیرتیفوئیدی 🦠 برای غلبه بر استرس اکسیداتیو در روده، از یک سیستم آنزیمی جدیدی استفاده می‌کند که به کوفاکتور مولیبدن نیاز ندارد 🧬. این مکانیسم مبتنی بر سولفات ردوکتازهای Xsr (شامل Xsr1A، Xsr2A و Xsr3A) است که با استفاده از مراکز [4Fe–4S]، بیماری‌زایی و بقای باکتری را در میزبان تضمین می‌کنند 🛡️. این کشف، الگوی تکاملی ماژولاری را در ابرخانواده MopB نشان می‌دهد که کاتالیز وابسته به آهن-گوگرد را پدیده‌ای گسترده‌تر از تصور پیشین می‌داند 🔬✨. گردآورنده: SDA @bazaarlab منبع: Salmonella uses sulfate reductases with unique catalytic activity to promote gut colonization in mice | Nature Microbiology https://share.google/QgDc0YNIFrqhJsCtE

#موجودی سلام وقت شما بخیر ۱۶ عدد کووت الکتروپوریشن در سه سایز برند اپندرف ۶ کووت عرض ۱ ۳ کووت عرض ۲ ۷ کووت عرض ۳ و یک جعبه 25 تایی مربوط به کپیلارهای نگهدارنده استریل (Sterile VacuTips) ساخت برند معتبر Eppendorf آلمان. و یک جعبه کاپیلارهای شیشه‌ای بسیار ظریف Femtotips و سرسمپلرهای مخصوص Microloader از برند Eppendorf تماس با @diamondbarbers

پژوهشگران با بهره‌گیری از پلتفرم هوش مصنوعی ContactSeek مبتنی بر مدل AlphaFold3، به دستاورد شگرفی در ارتقای اختصاصیت و افزایش چشمگیر دقت ابزارهای ویرایش بازهای DNA دست یافته‌اند. ارتقای اختصاصیت در مهندسی ژنوم جهت کاهش حداکثری اثرات خارج از هدف و تضمین ایمنی و کارایی در درمان‌های ژنتیکی اهمیت حیاتی دارد، اما رویکردهای سنتی همواره با چالش‌های پیچیده‌ای مانند موازنه منفی میان میزان فعالیت کاتالیزوری و دقت آنزیم روبرو بوده‌اند. پلتفرم نوآورانه ContactSeek با تحلیل دقیق احتمال اتصال پیش‌بینی‌شده توسط AlphaFold3، تعاملات بیوشیمیایی و ساختاری را در سطحی بسیار حساس‌تر از مدل‌سازی‌های سه‌بعدی مرسوم ارزیابی می‌کند. این مدل هوشمند با نگاشت موقعیت‌های خارج از هدف ویرایشگرهای باز آدنین و همبستگی داده‌های توالی‌یابی با احتمال اتصال، توانسته است نواحی تماس اجماعی را به دقت شناسایی کند. این نواحی شامل باقیمانده‌های آمینواسیدی مجاوری در ساختار آنزیم Cas هستند که تغییرات اتصالی پایداری با زنجیره DNA یا RNA راهنما نشان می‌دهند. ارزیابی‌های جامع آزمایشگاهی از جمله توالی‌یابی هدفمند آمپلیکون، پروفایل‌سازی محاسباتی کل ژنوم و سنجش‌های R-loop به وضوح تأیید می‌کنند که واریانت‌های مهندسی‌شده توسط این پلتفرم عملکردی به مراتب برتر از ویرایشگرهای با دقت بالا (High-Fidelity) موجود دارند. این چارچوب هوش مصنوعی که با موفقیت روی ویرایشگرهای باز سیتوزین مبتنی بر Cas12a نیز پیاده‌سازی شده است، پارادایم جدیدی را در یکپارچه‌سازی ابعاد ساختاری و عملکردی پروتئین‌ها برای توسعه ابزارهای دقیق زیست‌پزشکی و ژن‌درمانی پایه‌گذاری می‌کند. گردآورنده: SDA @bazaarlab منبع: https://www.techscience.com

#نیازمندی سلام وقت بخیر پودر محیط اشنایدر نیازدارم با پرداخت هزینه تماس با @mhfouani 09195202381 با تشکر

@moonaria سلام وقت همگی بخیر دوستان من نیاز به آنزیم phi 29 شرکت ترموفیشر دارم دانشگاه علوم‌پزشکی تهران در صورت موجودی لطفا حتما به من اطلاع بدید خیلی ممنونم🙏🏻 @moonaria

کشف ارتباط گسترده میان فاکتورهای رونویسی ناشناخته و «ماده تاریک» ژنوم انسان 🧬🔬 مطالعه‌ای جدید که در مجله Nature Communications به چاپ رسیده است، عملکرد بخش قابل‌توجهی از ژنوم انسان که با عنوان «ماده تاریک DNA» شناخته می‌شود، را آشکار نموده است. این مناطق عمدتاً متشکل از توالی‌های تکراری و عناصر جابجاشونده هستند که تا پیش از این، کارکرد دقیق آن‌ها مبهم باقی می‌ماند. 📜 پژوهشگران در این تحقیق، محل اتصال ژنومی ۱۶۶ فاکتور رونویسی (TF) کم‌شناخته انسان را در سلول‌های زنده شناسایی کردند. یافته‌ها حاکی از آن است که تقریباً نیمی از این فاکتورها به نواحی تنظیمی شناخته‌شده نظیر پروموترها و انهنسرها متصل می‌گردند. در مقابل، نیمه دیگر که توسط محققان «فاکتورهای رونویسی تاریک» نام‌گذاری شده‌اند، تمایل ویژه‌ای به اتصال به توالی‌های تکراری در نواحی کروماتین بسته (ماده تاریک ژنوم) از خود نشان می‌دهند. 🧬🔍 این فاکتورهای تاریک عمدتاً نقش سرکوب‌کننده ایفا کرده و به خاموش‌سازی عناصر جابجاشونده یاری می‌رسانند. با این وجود، برخی از آن‌ها مانند TPRX1 به مثابه فاکتورهای رونویسی پیشگام (Pioneer) عمل کرده و منجر به باز شدن ساختار کروماتین و تغییر معماری آن در این نواحی می‌شوند. این کشف، ابعاد جدیدی را در تکامل شبکه تنظیمی ژن‌ها و عملکرد عناصر تکراری ژنوم انسان روشن می‌سازد. 💡🧬 گردآورنده: SDA https://t.me/bazaarlab لینک مقاله: https://www.nature.com/articles/s41467-026-75376-z 🔗

📣بیستمین نمایشگاه تخصصی دام؛ طیور؛ آبزیان؛ دامپزشکی و صنایع وابسته 🔹۲۷ لغایت ۳۰ مرداد؛ ساعت ۱۶ تا ۲۱؛ نمایشگاه بین‌المللی مشهد ☘اخبار نمایشگاه بین‌المللی مشهد را در کانال ایتا نیز دنبال کنید https://eitaa.com/nammanegar ☘روابط عمومی نمایشگاه بین‌المللی مشهد @Mashadexpo

#نیازمندی با سلام متقاضي -Propidium iodide -Calcein AM به مقدار 2mg از هر كدام جهت خريد. تماس با @Vahidreza_Keramati

#نیازمندی سلام وقتتون بخیر. مقداری رنگ DiR لازم دارم. هزینه پرداخت میشود. ممنونم تماس با @zara_hash97

#نیازمندی سلام وقت بخیر، گلایکولیک اسید ۱۰۰ میلی گرم آلانتوئین ۲۰ میلی گرم اسید هیالورونیک ۵۰ میلی گرم نیاز دارم. گرید آزمایشگاهی باشه. خیلی ممنون تماس با ۰۹۹۳۰۷۴۲۳۱۱

#نیازمندی سلام عرض می‌کنم وقت به خیر با تشکر از زحمات شما ادمین محترم نیازمند رده‌ی سلولی pc3 هستم. ممنون میشم راهنمایی بفرمایید. سپاسگزارم. تماس با ۰۹۹۸۲۳۵۲۹۵۵

نیازمندی هود لامینار کلاس ۲ عرض ۱۰۰تا۱۲۰، بالابر برقی. ترجیحا دست دو @Pourya_NM

#موجودی کاغذ نیتروسلولز و کاغذ PVDF از کار پایان نامه باقی مانده و به قیمت مناسب به صورت کامل حدود یک متر از هر کدام و یا به صورت قطع ۸سانتی متر در ۲۶/۵ و ۸ در۳۰ به فروش میرسد یک عدد تبلت مهارکننده پروتئاز و فسفاتاز برند Roche موجود است @arnikaa97