Канал "Практическая биоинформатика"

🧬✨ Погрузись в биоинформатику на бесплатных вебинарах ПИШ НГУ Мы знаем, как вы любите учиться! Именно поэтому совсем скоро у нас пройдут бесплатные вебинары по биоинформатике. На вебинарах вы сможете погрузиться в мир науки на стыке биологии, анализа данных и искусственного интеллекта 🚀 Разберём два направления, которые сегодня активно развиваются в биоинформатике: 🤖 7 июля, 18:00 (нск) / 14:00 (мск) «Как нейросети помогают создавать термостабильные ферменты: на примере глиадин-гидролазы KumaMax для терапии целиакии» Поговорим о том: — как ИИ помогает проектировать белки и ферменты — как анализировать структуру белка — как находить мутации, которые улучшают свойства белков 🧬 22 июля, 18:00 (нск) / 14:00 (мск) «SNP и GWAS: сетевая интерпретация без кода» Узнаем: — как работать с результатами GWAS — как находить связанные гены — как строить генные сети и понимать биологический смысл данных 📌 Если вы хотите научиться не просто получать результаты анализа, а понимать их биологический смысл — присоединяйтесь. Регистрация здесь: https://clck.ru/3ULaW9

https://www.youtube.com/playlist?list=PL8nkomsB9uVPglX634UWEZweSjZS1ovS_ Плейлист "Машинное обучение и нейросетевые методы анализа изображений" Ульяны Зубаировой (ИЦИГ СО РАН, НГУ) Версия в ВК https://vkvideo.ru/@ai4bio

💊⚙️ Платформенные технологии в биомедицине: почему инновациям нужны регуляторные апдейты? На круглом столе разберем мировой опыт и обсудим перспективы внедрения новых правовых механизмов для российской биофармы. 📍Когда и где? 30 июня, 16-00 мск, ОНЛАЙН Как перейти от штучной разработки к «конвейерному» режиму создания инновационных препаратов, и какие шаги для этого необходимо предпринимать уже сегодня? Недавно ИЦ «Хелснет» совместно с АНО «Инновационный инжиниринговый центр» выпустили отраслевой отчет, посвященный концепции технологических платформ в биомедицине – новому регуляторному подходу, который позволяет обоснованно переиспользовать данные для воспроизводимой, хорошо изученной технологии и регистрировать препараты по ускоренной схеме. 🔎 Сегодня в эту сторону смотрит весь мир – Китай, Япония, страны ЕС, но пионерами стали США. Отчет подробно разбирает опыт внедрения механизма FDA PTDD на американском рынке и оценивает потенциал аналогичного регуляторного эксперимента для России и ЕАЭС. 📣 В рамках круглого стола состоится презентация аналитического исследования, а также вместе с экспертами мы постараемся разобраться в перспективах и рисках внедрения такого правового режима в России – с точки зрения регулятора, фарминдустрии и академической школы. Что на повестке: 🟠 Что такое «Программа присвоения статуса платформенной технологии» FDA? Разберем успешные и провальные кейсы применения в США. 🟠 Почему платформенный подход в России – это уже не вопрос «если», а вопрос «когда» и «как»? 🟠 Как совместить ускорение и безопасность и выстроить систему постмаркетингового мониторинга для платформ? 🟠 Какая из технологий на рынке РФ (мРНК, AAV, CAR-T, плазмидные ДНК) наиболее готова к платформенному регулированию? 🟠 Какие существующие механизмы (госпитальное исключение, условная регистрация) можно адаптировать для платформенной логики? Спикеры: 🌟 Роман Иванов – председатель Ученого совета Университета «Сириус», член Научно-технологического совета,  директор  Научного центра трансляционной медицины, научный руководитель направления «Медицинская биотехнология» 🌟 Ольга Фёдорова – проректор по научной работе и последипломной подготовке СибГМУ 🌟 Представители ФГБУ «НЦЭСМП 🌟 Олег Лавров – советник генерального директора АНО «Инновационный инжиниринговый центр» (компания «Иннопрактика»)  🌟 Михаил Самсонов – медицинский директор «Р-Фарм» 🌟 Мария Галямова – руководитель ИЦ «Хелснет» НТИ 🎙 Модератор – Владимир Андрианов, директор по работе с партнерами «Р-Фарм», заместитель лидера рабочей группы «Хелснет» По итогам мероприятия будет сформулирован запрос к регуляторным органам о необходимости формализации платформенного статуса в праве ЕАЭС, а также сформирована рабочая группа (разработчики, регуляторы, эксперты) для дальнейшей работы над пилотным проектом.   ❗️ Регистрация обязательна: https://leader-id.ru/events/608566 Приглашаем всех причастных и сочувствующих присоединиться к профессиональной дискуссии! #фарма #регуляторы #биомедицина #биотехнологии #мРНК #генотерапия

Создание веб-приложения для работы с базой данных // Александр Бобровских, НГУ https://vkvideo.ru/video-205185234_456239271 Ссылка на код: https://disk.yandex.ru/d/k_ZKq6-aAtgJVA

Создание базы данных в MySQL Workbench // Александр Бобровских, НГУ https://vkvideo.ru/video-205185234_456239270 Данные для практикума: https://disk.yandex.ru/d/iS-DbmBHwD83nA

Пятое видео из плейлиста "Статистика в Python" от Александра Вихорева U-тесту Манна-Уитни https://vkvideo.ru/video-205185234_456239268

Шестое видео из плейлиста "Статистика в Python" от Александра Вихорева посвящено проверке мощности статистических тестов https://vkvideo.ru/video-205185234_456239269

ВЕБИНАР ПИШ НГУ🔬 От списка генов до гипотезы: чем могут быть полезны базы данных и генные сети? После анализа омиксных данных у вас на руках оказывается список генов — но не всегда понятно, что с ним делать дальше и как превратить его в осмысленные выводы. 🗓 13 МАЯ 14:00 (НСК), 10:00 (МСК) - ВЕБИНАР «От списка генов до гипотезы: чем могут быть полезны базы данных и генные сети?» Этот вебинар для молодых учёных, магистрантов и начинающих биоинформатиков, работающих с омиксными данными и сталкивающихся с интерпретацией генов, обоснованием кандидатных генов и формулировкой гипотез, а также для тех, кто ищет системный и воспроизводимый подход к анализу данных. Подключайтесь к вебинару и разберитесь, как: • собрать «досье» на ген: функции, мутации, связь с заболеваниями🧬 • находить и использовать информацию в биологических базах данных • понимать взаимодействия гена и его биологический контекст • определять участие гена в биологических путях и генных сетях • превращать результаты анализа в научную гипотезу и наглядную визуализацию📊 *На вебинаре обойдёмся без программирования и разберём универсальный алгоритм интерпретации на примере онкогена и RNA-seq данных. 👉 НАЖИМАЙТЕ СЮДА И РЕГИСТРИРУЙТЕСЬ. Сделайте шаг от списка генов к понятной биологии и готовым гипотезам✨

От базы данных – к веб-приложению // Александр Бобровских, НГУ https://vkvideo.ru/video-205185234_456239265

https://vkvideo.ru/video-205185234_456239264 Четвертое видео из плейлиста "Статистика в Python" от Александра Вихорева посвящено проверке t-критерию Стьюдента

https://vkvideo.ru/video-205185234_456239262 Третье видео из плейлиста "Статистика в Python" от Александра Вихорева посвящено проверке равенства дисперсий

https://vkvideo.ru/video-205185234_456239261 Второе видео из плейлиста "Статистика в Python" от Александра Вихорева посвящено проверке нормальности распределения

https://vkvideo.ru/video-205185234_456239260 Первое видео из плейлиста "Статистика в Python" от Александра Вихорева посвящено работе с распределениями

https://vkvideo.ru/video-205185234_456239259 Основные принципы организации баз данных // Александр Бобровских, НГУ

Открыта регистрация на 2025/26 учебный год Цифровой кафедры НГУ "Практическая биоинформатика и молекулярная биология" для студентов бакалавриата, специалитета, магистратуры, ординатуры (не-IT-специальностей) Ссылка на регистрацию (до 11 октября 2025): https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSdSbsuWuFoe4iw3w6wF-imJBD8NU8DqpcRHjfYSDc7n63KqZA/viewform Информация о программах Цифровой кафедры НГУ: https://education.nsu.ru/digital-section/ Просим распространить среди тех, кому это может быть интересно!

#зоопарк_одобряет Многие слышали, что AIRI раз в год проводит летнюю школу для юных падаванов, постигающих азы научной работы в области искусственного интеллекта. Последняя прошла в июле в Томске, и мы её даже анонсировали. Дело это благое, учитывая, что участие в школе бесплатное. Вдвойне приятно, что организаторы на днях выложили плейлист со всеми лекциями, чтобы их могли посмотреть даже те, кто не смог пройти отборочный этап: VK Видео, YouTube. Лекции будут полезны в том числе и тем, кто, как и мы, не особо разбирается в машын лернинге, поскольку, помимо чистого ИИ, там многое есть и о его применении в других областях: химии, биологии, инженерии и даже строительстве.

🔊 Xll Российский Форум биотехнологий OpenBio - коллаборация науки, бизнеса и государства! В этом году вас ждёт: ✔️ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ в 6 секциях (биотехнология, молекулярная биология, фундаментальная медицина, биоинформатика, биофизика, вирусология), на которых выступят с лекциями ведущие ученые и 100 молодых специалистов, которые будут бороться за звание лучших и ценные призы. ✔️ БИЗНЕС-ФОРУМ - экспертные дискуссии, круглые столы, выступления лидеров отрасли, мастер-классы, презентации новых технологий и оборудования. ✔️ ОТРАСЛЕВАЯ ВЫСТАВКА биотехнологических и биофармацевтических компаний, где вы сможете посмотреть и протестировать новейшее оборудование или продемонстрировать свою продукцию/услуги 1000+ заинтересованным специалистам 📌 Вас ждёт масштабный нетворкинг, а это возможность для полезных знакомств, поиска новых кадров и заключения взаимовыгодных контрактов. Деловые мероприятия OpenBio пройдут в гибридном формате с возможностью подключения к онлайн-трансляции. Но мы рекомендуем участие вживую! 📰 С подробной программой мероприятий вы можете ознакомиться по этой ссылке - программа развивается, следите за обновлениями 😉 ➡️ ЗАРЕГИСТРИРОВАТЬСЯ на OpenBio 🗓️ 23-26 сентября 2025, наукоград Кольцово. Реклама. АНО "Инновационный центр Кольцово". ИНН: 5433141963. erid: 2VtzqwwzhrH

https://vk.com/video-205185234_456239258

Во втором видео из цикла "Транскриптомика" Александр Бобровских рассказывает об обработке данных транскриптомов единичных клеток (single cell) https://vk.com/video-205185234_456239257