Учебно-научная секция ИФМиБ

НИЛ «Регуляторная геномика» совместно с кафедрой морфологии и общей патологии объявляет набор студентов для выполнения курсовых и дипломных работ! Для кого: студенты 1–4 курсов бакалавриата, интересующиеся молекулярной биологией, патофизиологией, нейронауками, биоинформатикой и цифровой патологией. Мы занимаемся регуляторной геномикой, экспериментальным моделированием патологических процессов на животных и разработкой систем визуализации и анализа биомедицинских изображений. В лаборатории можно работать как «на руках» (животные, гистология, молекулярка), так и «на компьютере» (биоинформатика, анализ изображений, цифровая патология, статистика и т.д.). Проекты, к которым можно присоединиться уже сейчас: 1) Исследование нейрорегенерации седалищного нерва у Acomys cahirinus (иглистая мышь) 2) Исследование регенерации скелетной мускулатуры в разных моделях повреждения, с оценкой воспаления, фиброза и восстановления структуры мышечных волокон. 3) Обширный проект в области digital pathology: разработка и тестирование платформы для быстрого, стандартизированного и воспроизводимого анализа биомедицинских данных и тканей (гистологические изображения, морфометрия, multi-omics data с применением методов машинного обучения). Чему вы научитесь: 1) Базовым и продвинутым методам молекулярной биологии и гистологии; 2) Основам биоинформатического анализа (работа с данными RNA-seq, базами данных, скрипты на Python/R); 3) Принципам построения экспериментальных моделей, планирования исследований и анализа полученных результатов, подготовке научных постеров, статей и презентаций. 4) Много чему ещё) Если вы хотите попробовать себя в реальной научной работе, разобраться, как из сырых данных получается осмысленный результат, и сделать курсовую/дипломную, о которой не стыдно рассказать - приходите на собеседование! Для записи на собеседование заполняйте форму: https://forms.gle/2cYhRSX2tTWVLpyK9

и вот скрипт чтобы сделать все что представлено в презентации:

сегодняшняя лекция по транскриптомике

Курсы по биоинфе на степике: https://stepik.org/course/54206/?search=9461696858 https://stepik.org/course/2557/promo?search=9461696524 https://stepik.org/course/179776/promo?search=9461696518

Лето - прекрасное время для новых профессиональных вызовов!⭐ С 3 по 8 августа в Санкт-Петербурге пройдет летняя Школа Алферовского университета «Методы секвенирования ДНК и приборы для их реализации». Мы приглашаем активных старшекурсников, аспирантов и молодых ученых, которым интересны современные генетические технологии. 🔹 Главный акцент нашей Школы - это настоящая практика. Вы будете работать в малых группах над реальными исследовательскими проектами. Вместе с наставниками мы пройдем весь путь от постановки научной проблемы до анализа экспериментальных данных. В вашем распоряжении будет современное российское и зарубежное оборудование, на котором вы освоите ПЦР-диагностику, секвенирование нуклеиновых кислот и другие исследовательские методики. Своим опытом поделятся ведущие ученые из Алферовского университета, ИАП РАН и Института экспериментальной медицины. А чтобы показать, как фундаментальная наука взаимодействует с бизнесом, к нам присоединится индустриальный партнер - биотех-компания ООО «Синтол». Обучение полностью бесплатное. После успешного завершения программы каждый участник получит официальный сертификат о повышении квалификации государственного образца. Узнать все детали и посмотреть подробную программу можно здесь. 👉 Подать заявку нужно до 30 июня по ссылке.

Подавайтесь сюда:

Приглашаем присоединиться к лекции в рамках магистерской программы Томского НИМЦ “Биоинформатика: Мультиомика единичных клеток”. 🧬 Тема: Клональный анализ на уровне индивидуальных клеток на службе биологии развития 🧑‍🔬Лектор: Игорь Адамейко, Венский медицинский университет 📅 Дата: 26 июня 🕒 Время: 11:00 Мск 💻 Платформа: Zoom На лекции будут рассмотрены возможности клонального анализа на уровне индивидуальных клеток как инструмента для прослеживания происхождения, судьбы и дифференцировки клеток в процессе формирования тканей и органов. Будет показано, как современные методы генетического мечения, высокопроизводительного секвенирования и анализа единичных клеток позволяют с беспрецедентной точностью исследовать процессы принятия клеточных решений. Особое внимание будет уделено интеграции клонального анализа с одноклеточной транскриптомикой и пространственной биологией для изучения эмбрионального развития, регенерации и пластичности клеточных популяций, а также установлению причинно-следственных связей между генетическими программами и формированием функциональных структур организма. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре

Д

Этот 319?

Ребята всем привет Кто не знает как дойти до 319 тот лох Шучу, заходите в здание карла маркса 74, поворачиваете направо, идете на третий этаж, первая дверь слева (не туалеты)

Привет! Напоминаем про завтрашний воркшоп: не забудьте вторую обувь/бахилы, студенческий и захватите ноутбук на практическую часть!

Придешь 20 июня на воркшоп? 👩‍💻

Лето началось, а мы проводим еще одно занятие по биоинформатике! 👩‍💻 На этой, последней в этом учебном году, встрече мы познакомимся с транскриптомикой и разберем основные этапы анализа RNA-seq данных 🧬 На занятии вы узнаете: • что такое транскриптомика и какие биологические задачи решает транскриптомное секвенирование; • как устроены данные транскриптомного секвенирования; • также на практической части вы сами попробуете обработать данные и интерпретировать полученные результаты 🤓 Воркшоп подходит для студентов всех курсов и всех желающих. 📍Где: Карла Маркса 74, аудитория 319 ⏰Когда: 20 июня (суббота), 11:00 ⏳Длительность: 3-4 часа 🧬Ведущие: Перепеченов Степан и Воробьева Елизавета Добавляйтесь в группу учебно-научной секции ИФМиБ по ссылке и следите за чатом по биоинформатике: там можно задавать вопросы и смотреть материалы занятия 🪄 В этот чат мы также будем выкладывать материалы для воркшопа и важную информацию! ❗️Для практической части захватите с собой ноутбук. Также не забудьте студенческий и вторую обувь, чтобы войти в здание.