Генопоиск| ДНК-тесты

Фанагория: кем были жители крупнейшей греческой колонии на берегах Черного моря? Мы привыкли представлять древнегреческие колонии как маленькие островки Эллады, затерянные среди «варварского» мира. Однако новые генетические данные из Фанагории показывают куда более сложную и интересную картину. Фанагория была основана выходцами из малоазийского Теоса в VI веке до н. э. на Таманском полуострове. Позже город стал одной из столиц Боспорского царства и крупнейшим торговым центром Северного Причерноморья. Через его гавань проходили товары, люди и идеи из Средиземноморья, Кавказа и степей Евразии. Но кем были сами жители Фанагории? Недавно в открытом доступе появились новые генетические данные древних жителей города. Судя по префиксам образцов (Fan и FanKht), речь идет о материалах из Фанагории и связанных с ней памятников. Полная научная публикация по большинству этих образцов пока отсутствует, однако даже предварительный анализ позволяет увидеть любопытную картину. Оказалось, что население города было далеко не однородным. Часть образцов действительно демонстрирует генетическое сходство с современными греками и другими народами Восточного Средиземноморья. Вероятно, именно эти люди были потомками греческих колонистов или населения, прибывшего из Эгейского мира. Однако другие образцы показывают отчетливое сходство с современными народами Северного и Южного Кавказа. Это хорошо согласуется с историческими данными: греки на Боспоре активно взаимодействовали с местными племенами меотов, синдов и других народов региона. Еще один образец выглядит особенно интересно. По своему положению в генетическом пространстве он оказывается ближе к сарматам и другим степным популяциям Северного Причерноморья, чем к жителям Средиземноморья. Возможно, перед нами потомок кочевников, включившихся в жизнь античного города. Но самый неожиданный результат связан с одним из образцов группы FanKht. В его геноме заметен восточноазиатский компонент, значительно более выраженный, чем обычно наблюдается у скифов или сарматов. При сравнении с древними геномами этот человек демонстрирует сходство с некоторыми аварскими образцами раннего Средневековья. Пока без точного археологического контекста делать далеко идущие выводы рано. Это может быть человек эпохи Великого переселения народов, потомок мигрантов из восточных степей или просто редкий генетический аутлаер. Но сам факт его присутствия показывает, насколько широкими были связи Причерноморья. Самое важное здесь даже не происхождение отдельных людей. Археогенетика в очередной раз показывает, что культура и происхождение — не одно и то же. Ранее исследователи уже изучили мужчину и женщину из эллинистического склепа Фанагории II века до н. э. Погребение было выполнено по всем канонам греческой традиции. Однако генетический анализ показал, что их происхождение было различным: мужчина оказался ближе к населению Малой Азии и Кавказа, а женщина демонстрировала связи с более северными популяциями Восточной Европы. Получается, что быть жителем греческого города вовсе не означало быть этническим греком. Фанагория была не изолированной колонией переселенцев, а настоящим перекрестком цивилизаций. Здесь встречались потомки греческих колонистов, местное население Кавказа, степные кочевники и, возможно, люди, чьи корни уходили еще дальше на восток. Именно поэтому древняя ДНК сегодня становится одним из главных инструментов изучения античного мира. Она позволяет увидеть то, что невозможно восстановить только по керамике, архитектуре или письменным источникам: реальных людей, которые жили в этих городах более двух тысяч лет назад. 📚 Источники: — Рождественских Е.В. и соавт. «Историческая генетика Фанагории: геномный анализ людей из эллинистического склепа» — КСИА, вып. 282 — Разбор опубликованных G25-координат древних образцов Фанагории (Andvari) — Материалы экспедиции Института археологии РАН и проекта Евгения Рогаева. БЛОГ | VK | САЙТ

❤️Как 50 маркеров смогли заглянуть на 1500 лет назад Иногда результат ДНК-теста оказывается интереснее, чем ожидаешь. Наш сегодняшний пример — Y50, тест всего на 50 STR-маркеров. Это далеко не полное секвенирование Y-хромосомы и даже не специализированный SNP-тест. Но в одном из недавних случаев такой, казалось бы, простой анализ позволил сделать очень глубокую предикцию положения мужчины на Y-ДНК-дереве. И здесь начинается самое интересное. Сначала немного о том, что вообще делает Y50? Y50 анализирует 50 участков Y-хромосомы, в которых со временем происходят небольшие изменения — мутации STR. Сравнивая эти значения с другими мужчинами, можно понять, насколько близки их мужские линии. При этом Y50 не определяет конкретный SNP напрямую. Поэтому он не может сказать: «У вас точно есть мутация FT195072». Но если профиль очень хорошо совпадает с мужчинами, которые уже протестированы глубже и находятся на определённой ветви Y-ДНК-дерева, появляется возможность сделать предикцию — предположить, где именно на этом дереве находится новый участник. И вот здесь наш результат оказался действительно интересным. Заглядываем на древо YFull На дереве YFull наш образец оказался рядом с небольшой группой мужчин в районе ветвей R-FT195072 и R-Y4382. Возраст ветви R-FT195072 оценивается примерно в 1550 лет, а общий предок мужчин, находящихся на этой ветви, жил примерно 1500 лет назад. То есть если предикция верна, мы говорим уже не просто о принадлежности к большой гаплогруппе R или даже к более молодой ветви. Мы приближаемся к линии, которая формировалась примерно в раннем Средневековье. И это довольно впечатляющий результат для теста на 50 маркеров. Но есть ещё одна важная деталь Самое интересное — не только положение на дереве. Один из мужчин, уже находящихся внутри этой ветви, отличается от нашего образца всего на 5 мутаций из 50 маркеров. То есть по 45 из 50 STR-маркеров значения совпадают. Это очень полезная информация. Она не превращает Y50 в SNP-тест — по пятидесяти STR мы всё равно не можем напрямую сказать, что у человека есть FT195072. Но такое близкое STR-сходство с уже глубоко протестированным представителем ветви сильно поддерживает гипотезу, что наш образец действительно находится в этом же филогенетическом районе. Иными словами, мы получили своего рода генетический указатель: Y50 → близкий STR-профиль → известные образцы на YFull → конкретная ветвь Y-ДНК-дерева. А дальше можно копать ещё глубже Именно здесь становится особенно интересным сочетание разных типов тестирования. Y50 позволяет предположить направление. А глубокое SNP-тестирование — например, секвенирование Y-хромосомы — уже может проверить эту гипотезу непосредственно. Если FT195072 окажется положительным, предикция Y50 получит прямое подтверждение. Если же окажется отрицательным, это тоже полезный результат: значит, наш образец находится рядом с этой ветвью по STR, но относится к другой линии. Поэтому правильнее говорить не: «Y50 определил FT195072». А: «Y50 позволил с высокой вероятностью предположить положение образца в районе ветви R-FT195072». И это принципиальная разница между предикцией и прямым определением SNP. Почему этот пример нам нравится Обычно, когда человек слышит «50 маркеров», он представляет довольно поверхностный анализ. Но STR работают немного иначе. Удачное сочетание значений может оказаться достаточно характерным, чтобы сопоставить человека с уже исследованной группой мужчин и вывести его на довольно молодой участок филогенетического дерева. В нашем случае это потенциально ветвь возрастом около 1500 лет. То есть всего по 50 маркерам мы получили возможность заглянуть примерно в эпоху раннего Средневековья — и уже не просто сказать, к какой большой гаплогруппе относится мужчина, а предположить, в каком конкретном районе Y-ДНК-дерева находится его прямая мужская линия. А дальше начинается самое интересное: проверить эту гипотезу глубоким SNP-тестом и посмотреть, куда дерево поведёт нас дальше. Y50 — не финальная точка. Это навигатор. И иногда он показывает удивительно точный маршрут. БЛОГ | VK | САЙТ

Мы получили результаты очередного полногеномного секвенирования WGS 30× и решили показать их без маркетинговых формулировок, прямо по метрикам конкретного образца. Что получилось: — 30,6× — средняя глубина покрытия после маппинга — 32,9× — raw depth — 98,8% прочтений успешно картированы — 614 млн read segments — 92,2 ГБ данных — 6,7% дубликатов — 0,12% оценочная контаминация — 84,6% генома покрыто ≥30× — 97,1% генома покрыто ≥20× — 99,4% генома покрыто ≥10× Секвенирование выполнено на Illumina NovaSeq 6000, paired-end 2×150 bp. И вот здесь важно объяснить, зачем генеалогу вообще нужен WGS. WGS — это не очередной SNP-тест. Мы фактически считываем весь доступный геном, а затем из одного массива данных можем получать разные продукты и возвращаться к исходным данным снова по мере появления новых методов анализа. Для генетической генеалогии из этого WGS мы выдаём: BAM — полный файл выравнивания, 71,9 ГБ. Combined Kit — около 2,3 млн SNP для GEDmatch и других инструментов. 23andMe V5 — для совместимости с рядом генеалогических сервисов. Y-хромосому — для определения мужской линии и субклада. mtDNA — для анализа прямой материнской линии. И, конечно, остаётся сам BAM. Это принципиально: производные файлы можно пересчитать, обновить или сформировать заново. Исходные данные секвенирования не превращаются в одноразовый результат. Именно поэтому мы рассматриваем WGS как долгосрочный генеалогический актив: сегодня из него можно извлечь один набор информации, а через несколько лет — вернуться к тем же данным с новыми референсами, базами вариантов и алгоритмами. На картинке — не расчётные характеристики услуги и не обещания лаборатории, а показатели реального образца WGS17122. 30,6× mapped. 98,8% mapped reads. 99,4% генома ≥10×. Вот так, на наш взгляд, и должен выглядеть WGS 30×: когда качество можно показать цифрами, а клиент получает не только красивый отчёт, но и свои исходные геномные данные. WGS 30× от Генопоиска

Почему «встать в корень» Y-дерева — это иллюзия, а не повод для гордости Знакомая сцена: человек видит на дереве FamilyTreeDNA длинную прямую линию, уходящую вглубь веков, и заявляет: «Мы в самом корне, ветка наша, вы все пошли от нас». На самом деле эта линия говорит ровно одно: с ним пока никто не совпал. Это не биология, это дыра в данных. Собрал справочник по чтению дерева и раздела Discover. PDF, 19 страниц, 14 иллюстраций — все на фрагментах одного реального дерева. Внутри: • Доверительный интервал. Пунктир под узлом — это 95% CI, и это проверяется наложением на таблицу Scientific Details. Плюс разбор, что стоит за порогами 68 / 95 / 99% и почему сравнивать надо интервалы, а не точки. • Даты. Перевод BCE/CE в «лет назад» и в поколения. И ловушка: ybp у FTDNA считается от текущего года, а не от 1950, как в археологических статьях. • Анатомия узла. Узел — это один конкретный мужчина. Чем formed отличается от TMRCA, почему одна ветка на FTDNA и YFull называется по-разному и откуда берётся блок эквивалентных SNP. • Игра в царя горы. Густая ветка — это признак того, что родственники сдали тесты. Одинокая палка — признак того, что не сдали. Больше ничего. • Ловушка древней ДНК. Сармат на вашей ветке — не прямой предок, а боковая линия, разошедшаяся с вашей сто поколений назад. И его значок на шкале стоит не там, где ваш общий предок. • Чеклист из 7 шагов — что выписать по своей ветке и как зафиксировать, чтобы через полгода цифры не разъехались с сайтом. Подробнее в приложенном пдф файле.

❤️Почему базового теста мтДНК уже недостаточно? Еще совсем недавно большинство митохондриальных тестов анализировали только две небольшие области — HVR1 и HVR2. Для своего времени это был огромный шаг вперед. Но генетика развивается очень быстро. Сегодня известно, что гипервариабельные участки составляют лишь небольшую часть митохондриального генома. Основная информация, позволяющая определить точную ветвь происхождения, часто находится в кодирующей части митохондриальной ДНК. Именно поэтому современные научные исследования практически всегда используют полный митогеном, а не только HVR. Что это дает? • более точное определение гаплогруппы; • возможность обнаружить новые частные мутации; • корректное сравнение с древними геномами; • более надежный поиск общих материнских предков; • возможность использовать результаты в современных научных базах данных. Исследование Марии Шварновны — хороший пример того, насколько информативным может быть полный анализ митохондриальной ДНК. Если бы ученые ограничились только HVR-участками, часть информации о ее материнской линии была бы потеряна. Именно поэтому мировая палеогенетика давно перешла на полные митогеномы. И именно поэтому сегодня этот подход становится новым стандартом и в генеалогических исследованиях. Совсем скоро мы расскажем, как этот уровень анализа станет доступен и пользователям Генопоиска. БЛОГ | VK | САЙТ

❤️Почему древняя митохондриальная ДНК стала главным инструментом изучения женщин прошлого... История долгое время была историей мужчин. Летописи подробно перечисляют князей, полководцев и наследников престола. А вот о женщинах зачастую известно лишь имя, происхождение и дата смерти. Но у генетики другой взгляд. Каждый человек наследует митохондриальную ДНК только от матери. Она почти не меняется при передаче из поколения в поколение, благодаря чему становится своеобразной «генетической нитью», связывающей женщин одной материнской линии через десятки и сотни поколений. Именно поэтому митохондриальная ДНК играет огромную роль в палеогенетике. Когда археологи находят древнее захоронение, митогеном помогает: • определить материнскую гаплогруппу; • установить происхождение женщины; • сравнить ее с древними и современными популяциями; • реконструировать древние миграции; • выявлять родственные связи внутри некрополей. В исследовании Марии Шварновны ученые определили ее митохондриальную гаплогруппу U4b1a4. Само по себе название мало что говорит неспециалисту. Но за ним скрывается история миграций длиной в тысячи лет — от древних охотников-собирателей Восточной Европы до средневековых аланских элит. Еще десять–пятнадцать лет назад подобные исследования были доступны лишь крупнейшим научным лабораториям мира. Сегодня те же подходы постепенно становятся инструментом и для генеалогии. В следующем посте разберем, почему привычные тесты по коротким участкам митохондриальной ДНК уже не отвечают на многие вопросы, которые можно решить с помощью полного митогенома. БЛОГ | VK | САЙТ

❤️Мария Шварновна: ДНК разрушает стереотипы о княжеской Руси... Кого вы представляете, когда слышите слова «русская княгиня XII века»? Скорее всего, светлокожую женщину славянского происхождения, происходящую из одного из европейских княжеских домов. Но древняя ДНК заставляет пересмотреть этот привычный образ. Недавно опубликованное исследование генома Марии Шварновны — жены Всеволода Большое Гнездо и матери двенадцати детей — показало, насколько сложным было происхождение правящей элиты Древней Руси. На протяжении нескольких столетий историки спорили, кем была Мария. Одни летописи называли ее ясыней, связывая с аланской знатью Северного Кавказа. Другие считали ее чешской княжной. Теперь в спор вмешалась генетика. Сначала исследователи подтвердили, что останки действительно принадлежат представительнице княжеской семьи: анализ родства показал генетическую связь, соответствующую положению Марии как прабабушки предполагаемого Дмитрия Александровича — внука Александра Невского. Но самое интересное оказалось впереди. Геном Марии не похож ни на типичный восточнославянский, ни на современный северокавказский. Он представляет собой сложную мозаику происхождения. Исследование показало преобладание аланского генетического компонента, однако одновременно выявило заметный восточноевразийский вклад. По своему положению среди древних геномов Мария оказалась ближе к некоторым средневековым популяциям Центральной Азии, чем ожидали сами исследователи. Именно поэтому версия о ее аланском происхождении сегодня выглядит значительно убедительнее чешской. Это важный вывод не только для истории одной княгини. Он показывает, что элита Древней Руси была намного более разнообразной, чем принято думать. Династические браки соединяли княжеские дома Руси с Кавказом, степью, Византией и другими регионами Евразии, а происхождение правителей часто выходило далеко за рамки современных представлений о государственных и этнических границах. В следующем посте поговорим о том, почему именно митохондриальная ДНК сегодня становится одним из самых мощных инструментов для изучения женщин прошлого — даже тогда, когда письменные источники молчат. БЛОГ | VK | TG

❤️Северное Причерноморье I тысячелетия: что древняя ДНК рассказала о скифах, сарматах, аланах За последние годы археогенетика кардинально изменила наше представление об истории Северного Причерноморья. Если раньше археологи реконструировали прошлое преимущественно по артефактам и погребальным традициям, то сегодня древняя ДНК позволяет напрямую проследить происхождение людей, их миграции и родственные связи. В новой работе Евгения Рогаева и коллег впервые выполнен систематический обзор и метаанализ всех опубликованных полногеномных данных по населению Северного Причерноморья I тысячелетия нашей эры. В исследование вошли 48 древних геномов, относящихся к поздним скифам, сарматам, аланам, носителям черняховской и салтово-маяцкой культур, а также болгарам. Главный вывод исследования заключается в том, что история региона не была простой последовательной сменой народов. Генетические данные показывают значительно более сложную картину, где периоды миграций сочетались с сохранением местного населения. Так, поздние скифы Крыма демонстрируют генетическую преемственность с более ранними скифскими популяциями. Это означает, что смена археологической культуры далеко не всегда сопровождалась полной заменой населения. Совершенно иначе выглядит история сарматов. Геномы сарматов из Карпатского бассейна оказались удивительно близки сарматам Южного Урала. Более того, анализ длинных общих участков ДНК (IBD) выявил между ними недавнее родство, что стало одним из наиболее убедительных генетических доказательств масштабных миграций сарматских групп через всю степную зону Евразии в первые века нашей эры. Не менее интересны результаты по аланам. Самые ранние представители этой группы действительно близки к сарматам, однако более поздние аланы Северного Кавказа приобретают выраженный кавказский генетический профиль. Это говорит о том, что в процессе формирования аланского населения происходило активное смешение с местными кавказскими группами. Исследование также подтвердило высокую неоднородность салтово-маяцкой культуры. В геномах аланов и болгар присутствуют как кавказские, так и центральноазиатские и восточноевразийские компоненты, отражающие сложную историю формирования населения Хазарского каганата. Особое внимание авторы уделяют черняховской культуре. Генетический анализ показывает, что она не представляла собой единый народ, а объединяла несколько различных по происхождению групп. При этом получены первые данные, указывающие на возможную генетическую преемственность между частью населения черняховской культуры и ранними славянами. Авторы подчеркивают, что существующая выборка пока слишком мала для окончательных выводов, однако это направление выглядит одним из наиболее перспективных для дальнейших исследований. Несмотря на ограниченное количество доступных геномов, работа представляет собой первую попытку объединить разрозненные результаты археогенетических исследований в единую картину. Она наглядно показывает, что Северное Причерноморье на протяжении всего I тысячелетия нашей эры было одной из важнейших контактных зон Евразии, где миграции, культурные взаимодействия и смешение населения происходили значительно сложнее, чем предполагалось еще несколько десятилетий назад. Заказать свой ДНК тест БЛОГ | VK | TG

❤️Реальные цифры WGS — что скрывается за словом «геном» Недавно мы завершили обработку одного из образцов и хотим показать, как это выглядит изнутри — без маркетинга, просто цифры. Что секвенировали Мужчина из Псковской области. Обычная слюна, отправленная почтой. На выходе — полный геном. Что получилось по качеству — Покрытие генома: ~37–38× уникальных ридов. Это означает что каждая буква ДНК прочитана в среднем 37 раз — погрешность практически исключена — Процент маппинга: 99.98% — почти все прочтения легли точно на референсный геном человека — Дубликаты: всего 3.38% — библиотека получилась чистой, без лишнего шума ♂️По Y-хромосоме (отцовская линия) Это главное для генеалогии. После загрузки в YFull и жёсткой фильтрации осталось 17× покрытия — отличный результат для WGS. Система приняла файл, разместила на дереве и определила субклад R-VK06. Что это значит? Редкая ветвь R1a, сформировавшаяся около 550 лет назад. Общий предок всех четырёх известных носителей жил примерно 100 лет назад — то есть это уровень прадеда, документируемый через архивы. Все носители из Псковской области. Генеалогия и ДНК совпали идеально. ♀️По митохондриальной ДНК (материнская линия) Покрытие 6 467× — стопроцентное прочтение всех 16 569 позиций. Гаплогруппа определена надёжно. Что клиент получил на руки ✅ FASTQ ✅ BAM для YFull и TYT в формате Т2Т ✅ Суперкит для GEDmatch и MyHeritage ✅ 23andMe V5 /Генотек ✅ FTDNA V2/V3 Это не просто субклад — это полный геном который будет работать во всех генеалогических сервисах сейчас и через 10 лет, когда появятся новые инструменты анализа. Хотите так же? До конца месяца действует промокод DATA — скидка 10% на WGS. genopoisk.ru/wgs БЛОГ | VK | TG

Генопоиск| ДНК-тесты pinned a photo

Пока мы обсуждаем денисовцев, древние геномы и новые открытия археогенетики, многие откладывают собственное исследование «на потом». Хотя именно с личных данных начинается понимание своей семейной истории. Поэтому решили сделать небольшую, но, вероятно, последнюю акцию этого лета. До 1 августа действует скидка 10% на все генеалогические ДНК-тесты Genopoisk по промокоду DATA. Особенно хочется обратить внимание на WGS (полногеномное секвенирование). За последние несколько лет именно WGS стал новым стандартом генетических исследований. В отличие от отдельных тестов, он позволяет один раз получить практически полный набор генетических данных и затем использовать их для разных задач: • определить Y-хромосомную и митохондриальную гаплогруппы с максимальной детализацией; • загружать данные в базы и сервисы по мере появления новых инструментов; • проводить повторный анализ без необходимости пересдавать ДНК; • работать с древней ДНК, популяционной генетикой и генетической генеалогией по мере развития науки. Проще говоря, WGS — это не тест «на сегодня», а инвестиция в исследования на годы вперёд. Новые методы появляются постоянно, а самое главное ваши исходные данные уже будут готовы, не надо искать где обработать сотни гигабайт. Если же вы только начинаете знакомство с генетической генеалогией, сейчас хороший момент войти в неё с классических Y-ДНК или митохондриальных тестов, а затем при необходимости перейти на более глубокий уровень анализа. Base Y37 6 490 5 840 EXPERT Y-50 7 490 6 740 митоДНК 4 990 4 490 Мито с отчетом 5 990 5 390 FULL (Y50+мт) 14 990 13 490 Y-50) с отчетом 11 990 10 790 WGS 15X 49 900 44 910 WGS 20X 62 900 56 610 WGS 30X 73 900 66 510 📅 Акция действует до 1 августа включительно. 🎟 Промокод: DATA Скидка: 10% на всю линейку генеалогических тестов. УСПЕТЬ ЗАКАЗАТЬ После 1 августа цены вернутся к обычным — это последняя распродажа этого лета. БЛОГ | VK | TG

❤️Денисовцы: самые загадочные родственники человека, которых мы никогда не видели История открытия денисовцев — один из самых ярких примеров того, как генетика способна изменить представления об эволюции человека. В 2010 году международная группа учёных под руководством Сванте Паабо исследовала небольшой фрагмент фаланги пальца, найденный в Денисовой пещере на Алтае. По внешнему виду кость невозможно было отличить от останков других древних людей, однако анализ древней ДНК показал неожиданное: её владелец не принадлежал ни к неандертальцам, ни к Homo sapiens. Перед исследователями оказался представитель ранее неизвестной человеческой линии, получившей название денисовцы. Позже из этой же пещеры были изучены зубы, фрагменты костей и даже найден уникальный скелет девочки, мать которой была неандертальцем, а отец — денисовцем. Это стало первым прямым доказательством того, что разные виды людей свободно скрещивались между собой. За последующие пятнадцать лет денисовцы превратились из одной необычной находки в один из ключевых элементов истории человечества. Сегодня известно, что их ареал был огромным — от холодного Алтая до тропических районов Юго-Восточной Азии. Следы денисовской ДНК обнаружены в тибетской пещере Байшия, а анализ белков древних костей позволяет предполагать их присутствие и в других регионах Азии, где сохранить ДНК не удалось. Всё больше данных указывает на существование нескольких генетически различных популяций денисовцев, которые были разделены тысячами километров и, вероятно, сотнями тысяч лет независимой эволюции. Одним из главных открытий стало понимание того, что денисовцы неоднократно смешивались с предками современных людей. Если у большинства жителей Евразии денисовская примесь практически отсутствует, то у населения Океании — папуасов, меланезийцев и некоторых аборигенов Австралии — она достигает 4–6%. У народов Восточной Азии её значительно меньше, однако она представлена другими генетическими линиями, что говорит как минимум о нескольких независимых эпизодах смешения. Особенно известен ген EPAS1, отвечающий за адаптацию к высокогорью. Современные тибетцы получили его именно от денисовцев, благодаря чему способны жить на высоте более 4000 метров без хронической гипоксии. Это один из самых убедительных примеров того, как древнее межвидовое скрещивание принесло человеку полезную адаптацию. Однако чем больше учёные узнают о денисовцах, тем больше возникает вопросов. До сих пор неизвестно, как они выглядели. В распоряжении исследователей есть лишь несколько зубов, отдельные фрагменты костей и нижняя челюсть из Тибета. Мы не знаем их роста, телосложения, особенностей лица и культуры. Археологи также спорят, какие именно каменные индустрии были созданы денисовцами и насколько они отличались от технологий неандертальцев и ранних Homo sapiens. Не менее загадочной остаётся их эволюционная история. Когда именно денисовцы отделились от общего предка с неандертальцами? Почему они были настолько генетически разнообразны? Сколько различных популяций существовало одновременно в Азии? И самое интригующее — действительно ли часть их генома была унаследована от ещё более древнего, пока неизвестного человечества, которое не оставило после себя ни одного достоверно идентифицированного ископаемого? Археогенетика продолжает искать ответы на эти вопросы. Каждая новая находка способна изменить наши представления о происхождении человека так же, как это произошло в 2010 году. Возможно, денисовцы были не исключением, а лишь первым открытым представителем целого ряда древних человеческих линий, существовавших параллельно с нашими предками. Именно поэтому их история остаётся одной из самых захватывающих глав современной палеогенетики.

❤️Почему археогенетика переживает революцию именно сейчас? Кажется, что открытия в области древней ДНК происходят почти каждую неделю. То публикуют геномы скифов, то обнаруживают новую популяцию бронзового века, то пересматривают происхождение индоевропейцев. Создаётся впечатление, что археогенетика буквально переписывает историю человечества. Но почему именно сейчас? Ответу на этот вопрос посвящён Dispatch, опубликованный в журнале Current Biology. Поводом для него стала одна из самых обсуждаемых работ последних месяцев, показавшая, насколько стремительно развивается анализ древних геномов и как он меняет наши представления об эволюции человека. Ещё пятнадцать лет назад древняя ДНК использовалась в основном для решения локальных вопросов. Учёные могли определить митохондриальную гаплогруппу, иногда — Y-хромосомную линию, сравнить несколько популяций. Это были точечные исследования, ограниченные небольшим количеством образцов и относительно простыми методами анализа. Сегодня ситуация изменилась кардинально. Современные лаборатории получают сотни и тысячи древних геномов, а развитие биоинформатики позволяет изучать не только происхождение отдельных людей, но и процессы, которые происходили в популяциях на протяжении тысячелетий. Если раньше исследователи отвечали на вопрос «кто это был?», то теперь они могут спрашивать: «почему именно эта генетическая линия распространилась?», «какие мутации давали преимущество?» и «как менялся естественный отбор после перехода к земледелию?» Именно это автор Dispatch называет новой стадией развития археогенетики. Древняя ДНК перестала быть исключительно инструментом реконструкции миграций. Она становится способом наблюдать эволюцию практически в реальном времени. Например, теперь можно проследить, как изменялась частота отдельных вариантов генов на протяжении сотен поколений. Если какой-либо аллель начинает быстро распространяться в разных регионах, это может свидетельствовать о действии естественного отбора. Такой подход позволяет напрямую изучать адаптацию человека к новым условиям жизни — питанию, инфекциям, климату или образу жизни. Особое внимание автор уделяет тому, что ещё недавно подобные исследования были невозможны. Анализ современных популяций позволяет увидеть лишь конечный результат эволюции. Древние геномы впервые дают возможность наблюдать сам процесс: когда появилась мутация, насколько быстро она распространялась и какие исторические события могли повлиять на её судьбу. При этом автор напоминает, что археогенетика не отменяет археологию и историю. Генетические данные сами по себе редко дают полный ответ. Только совместный анализ археологических находок, радиоуглеродных датировок, письменных источников и древней ДНК позволяет строить достоверные модели прошлого. Именно поэтому сегодня всё больше исследований объединяют специалистов самых разных дисциплин: генетиков, археологов, антропологов, историков и специалистов по вычислительной биологии. Для нас, интересующихся происхождением народов и генетической генеалогией, это особенно важная тенденция. Каждая новая выборка древних геномов не просто добавляет ещё несколько точек на карту миграций. Она постепенно превращает историю человечества из набора гипотез в науку, которую можно проверять количественными методами. Возможно, именно это и является главным достижением археогенетики последних лет. Мы перестали только реконструировать прошлое — теперь мы начинаем понимать механизмы, которые формировали современное генетическое разнообразие человека.

Обобщил данные по всем доступным в qpADM группам русских (14 областей). Доля славянской предковой компоненты - 85% и с учетом регионов, по которым нет выборок, полагаю, что доля славянской предковой компоненты для русских в историческом ареале также будет в районе 85%. А если учесть плотность и численность населения (более высокую для южных и центральных русских регионов) то и того выше.

Реконструкция внешности человека позднего железного века из Ширакавана, Армения, от команды Ancestral Whispers. У мужчины, похороненного вместе с лошадью, были обнаружены травмы, обычно присущие всадникам. Посткраниальный анализ также предполагает частое использование мышц, соответствующее акту запуска копий. Этот мужчина относится к популяции, известной из урартских записей как Этиуни, являющихся прямым продолжением Лчашен-Мецаморской культуры, последней из армяноязычных Индоевропейских культур Южного Кавказа. Наиболее ранняя из этих культуры, Марткопи-Беденская, она же Раннекурганная, зародилась в результате миграции с севера степняков из поздней Ямной или близкородственной культуры, которая принесла индоевропейский протоармянский язык на Южный Кавказ и Армянское Нагорье, и их смешения с местным населением. Этиуни в последсивии будут завоёваны и присоединены урартами к их царству, а слияние населения Урарту породит армянский этнос. Чат канала для дискуссий. Подписывайтесь на наш канал Armenian DNA.

Мы приветствуем новых подписчиков на канале Генопоиск и расскажем о нас ❤️ Пост навигация! С 2018 года мы формируем рынок ДНК-тестирования. Сегодня мы — единственная компания, специализирующаяся на углублённой филогении Y-хромосомы и мтДНК и предоставляющая подробную аналитическую интерпретацию данных. Активно сотрудничаем с этническими проектами и частными инициативами. Как в лабораторной части , так и в полевых исследованиях. 📌 Что вы найдёте в нашем канале 🧬 Как понимать результаты ДНК-теста правильно — без мифов и упрощений 🗺 Истории миграций и родословных через данные генетики 🧠 Персональные кейсы клиентов и участников этнических проектов 📚 Обзоры исследований, статьи по популяционной археогенетике. Этот канал — для тех, кому важно понимание, а не «проценты по карте». 🧪 Что мы делаем? Y-ДНК — патернальные линии и структура рода мтДНК — материнская линия и её глубина WGS- полногеномное секвенирование специально для поиска предков с широким набором данных для различных сервисов. Комплексные отчёты — интерпретация, пишем развернутые отчеты , а не отписки в маркетинговой бижутерии. ➡️ Каждый результат проходит: контроль данных → верификацию → интерпретацию с опорой на научные источники. 📖 С чего начать? 1️⃣ Прочитать наш блог с актуальным материалами о том, как устроен ДНК-тест на самом деле 2️⃣ Посмотреть посты с меткой #база или #генопоиск 3️⃣ Если нужен совет — написать напрямую в суппорт @Gnpsk 📩 Заказать анализ / задать вопрос 👉 @Gnpsk Мы не продаём файлы. Мы объясняем, что на самом деле говорит ваша ДНК.

❤️Один тест. Весь ваш геном. На всю жизнь. Представьте, что вы решили изучить историю своей семьи. Сначала купили один ДНК-тест, потом второй , чтобы узнать происхождение по мужской линии. Затем третий - по женской. Через год появился новый сервис, требующий другие данные. Потом еще один... Так происходит у большинства людей. Кто-то тратит на это сотни тысяч рублей и годы жизни. Сегодня более 90% рынка составляют чиповые ДНК-тесты. Они исследуют лишь небольшую часть генома , сотни тысяч заранее выбранных маркеров (а точнее около 650к) из более чем 3 миллиардов пар оснований человеческой ДНК. Для большинства попсовых задач этого достаточно. Но возможности таких тестов изначально ограничены. Если завтра появится новый алгоритм анализа или новый сервис — велика вероятность, что нужных данных в вашем тесте просто не окажется. С полногеномным секвенированием (WGS) ситуация совершенно другая. Во время WGS считывается практически весь ваш геном. Это не выборка отдельных маркеров, а цифровая копия вашей ДНК, которую можно анализировать снова и снова по мере развития науки. Именно поэтому WGS это не просто тест. Это генетический актив на всю жизнь. Сегодня вы можете использовать его для поиска родственников и изучения происхождения, а через несколько лет получать новые интерпретации без повторной сдачи материала. Просто сохраните в облако данные которые мы предоставим. Для любителей генеалогии возможности практически безграничны. Из одного исследования можно получить данные для поиска родственников в крупнейших международных базах (GEDmatch), определить происхождение по мужской линии вплоть до терминального субклада (YFull), попасть на мировые генетические древа Yfull и TheYtree , исследовать древние популяции и сравнить себя с археологическими находками (IllustrativeDNA), работать с сервисами FTDNA, Genomelink и многими другими. Самое приятное, что ничего не нужно конвертировать самостоятельно. Мы подготавливаем все необходимые файлы в готовом виде. Вам остается лишь загрузить их в нужный сервис и сразу получить результаты. Не нужно разбираться в форматах BAM, FASTQ или VCF, искать инструкции или использовать сторонние программы, использовать мощнейший сервак. Все делаем мы сами,а в нашем блоге всегда можно узнать подробности. Один тест = десятки направлений анализа. Но генеалогия - лишь половина истории. Медицина для WGS30X Ваш геном содержит информацию, которая с каждым годом становится все ценнее для медицины. Постоянно появляются новые научные публикации, методы интерпретации и алгоритмы анализа наследственных особенностей организма. То, что сегодня невозможно определить, через несколько лет может стать обычной частью генетического анализа. Если у вас уже есть качественный WGS, пересдавать ДНК не потребуется. Достаточно повторно проанализировать уже существующие данные. По сути, вы инвестируете не в отчет, который актуален только сегодня, а в собственную цифровую генетическую библиотеку, которая будет приносить новую информацию многие годы. Именно поэтому все больше специалистов считают полногеномное секвенирование логичным первым шагом, а не последним. Вместо того чтобы постепенно покупать разные тесты, ограниченные конкретными задачами, можно один раз получить полный геном и использовать его в десятках российских и зарубежных сервисов, возможности которых будут только расширяться. Один тест. Один образец ДНК. Один полный геном. Именно поэтому мы считаем WGS не очередным генетическим исследованием, а фундаментом, который закрывает практически все современные задачи , от семейной истории и происхождения, до медицинских интерпретаций. Потому что технологии меняются. Сервисы появляются и исчезают. Алгоритмы становятся точнее. А ваш полный геном остается с вами навсегда. ЗАКАЗАТЬ СЕЙЧАС! БЛОГ | VK | TG

❤️Чума не изменила наши гены, но переписала историю миграций. Новое масштабное исследование в bioRxiv проливает свет на то, как Вторая пандемия чумы (XIV–XIX вв.) повлияла на геном жителей Северной Европы. Учёные из Копенгагена, Исландии и Вены секвенировали ДНК 529 древних людей из Норвегии, Швеции и Литвы с высокой глубиной покрытия (8.8x). Главные выводы: ❌ Нет генетической защиты. Вопреки предыдущим гипотезам, исследователи не нашли следов сильного положительного отбора на защитные варианты генов после контакта с Yersinia pestis. Ни подтверждений старых данных, ни новых кандидатов. Чума убивала indiscriminately — без разбора по генетическому признаку. 📉 Конец мобильности. После прихода чумы во всех трёх регионах резко упала дальняя миграция. Разнообразие предковых компонентов снизилось. Это совпало с окончанием эпохи викингов, христианизацией и началом Малого ледникового периода. ⛪️ Парадокс христианизации. До пандемии христианизация, наоборот, коррелировала с ростом генетического разнообразия — вероятно, за счёт усиления контактов между регионами. История человечества — это не только биология, но и социальные процессы. Христианизация открыла границы, а чума и климатические изменения их закрыли. Наши предки стали менее мобильными, что отразилось на генетической структуре современных популяций Балтии и Скандинавии. 🔍 Хотите узнать свою историю глубже? ДНК-тест — это не просто «процентное соотношение» национальностей. Это ключ к пониманию того, какие исторические штормы пережили ваши предки. Современные полногеномные тесты позволяют: ✅ Определить точные гаплогруппы (mtDNA и Y-DNA) ✅ Найти генетических кузенов и восстановить генеалогическое древо ✅ Проследить миграционные пути вашей семьи через века. Особенно ценны данные для тех, кто интересуется палеогенетикой и хочет сопоставить свои результаты с древними образцами — от ямной культуры до средневековых захоронений. БЛОГ | VK | TG