Molecular Life

Доброго дня всем! Классная новость для всех желающих: у вас есть возможность написать пост от своего имени в любимый тгк Molecular Life (и заодно стать админом канала)! Если хотите попробовать, пишите в личку админу @bychekquerty

Запах после дождя 💦Да, сегодня мы поговорим именно про него. Огромному количеству людей нравится этот запах (думаю, и вам тоже). Вероятно, именно поэтому ему придумали даже собственное название: петрикор. Но откуда он берётся? Как всегда (или почти всегда) в природе, это сложная комбинация разных веществ: растительные масла, озон и геосмин. 🌿Растительные масла, в отличие от других компонентов петрикора, крайне разнообразны, именно поэтому запах дождя может сильно варьировать. Озон, как мы знаем, вырабатывается при грозовых разрядах и вносит свой вклад в запах после дождя. Наконец, геосмин. Весьма интересное вещество, которое не на слуху (по сравнению с тем же озоном). Ему приписывают запах земли. Откуда он берётся? Его синтезируют самые разные микроорганизмы: от цианобактерий до актиномицет. Интересно, что человеческие рецепторы очень чувствительны к этому веществу. 5 молекул геосмина на триллион других молекул — именно таков порог нашей чувствительности (например, для озона этот же показатель составляет 10 молекул на миллиард). Хочется узнать откуда такие сумасшедшие цифры. Наверняка сделать это невозможно. Но есть пара хороших теорий. ✔️Первая связывает эту сверхчувствительность с тем, что нашим предкам было крайне важно находить водоёмы (банально, чтобы утолить жажду). Геосмина намного больше вырабатывается обитателями водоёмов, и наши предки могли по нему ориентироваться в поисках воды. ✔️Вторая теория напоминает нам о том, что при большой концентрации мы воспринимаем геосмин как что-то неприятное. Так, например, может пахнуть испорченная рыба или другие продукты питания. Тогда наша сверхвосприимчивость связана именно с желанием человека понять безопасен ли какой-то продукт питания. 😎На этом наш пост заканчивается. А вы наслаждайтесь и дождём, и солнцем! До новых постов! #molecular_life #мини

Геосмин

5. Изомеразы. Катализируют реакции с образованием продукта-изомера. Причём это может быть как структурный, так и пространственный изомер субстрата. Представьте, что вы взяли и перешили пуговицу с одного места вашей рубашки на другое место, но всё той же рубашки. Так работает изомераза. Рацемазы, эпимеразы, мутазы — всё сюда. 6. Лигазы. Катализируют реакции соединения 2 молекул с образованием новой химической связи за счёт реакций конденсации, сопряжённых с гидролизом АТФ. Частенько при этом может происходить отщепление химической группы от одной из молекул. Пусть вас это не смущает. Этот фермент берёт и сшивает 2 молекулы. Но лиазы тоже так умеют! Что же делать? Всё решает АТФ! Реакции лигаз идут за счёт энергии гидролиза АТФ. 7. Транслоказы. Изначально этого класса ферментов не было. Да и сейчас ведутся споры о правильности включения этого класса в общую классификацию. Почему? Потому что это самый НЕхимический класс ферментов: на входе и на выходе мы имеем одну и ту же молекулу. Так в чём же смысл? Биологизм процесса: перенос ионов и молекул через мембраны! В клетках много мембран, и организм должен уметь преодолевать эти препятствия. Кстати говоря, названия у многих из этих ферментов остались прежние: с тех времён, когда они были разбросаны по другим 6 классам… #molecular_life #олхим

Классификация ферментов Сегодня обсудим действительно важную тему в биохимии, которая, кстати, частенько встречается в олимпиадах! Речь идёт о классификации ферментов. 😺Ферменты — мегаклассная штука. Ускорение до 10 в 20-ой степени раз! Да и если бы не было ферментов, как бы мы жили? Вот вы съели что-нибудь, а чтобы получить энергию надо подождать немало. Всего какой-то годик-другой… ✍️В настоящее время используется классификация Международного союза биохимии и молекулярной биологии 2018 года. В её основе — тип катализируемой реакции. По этой классификации выделяют 7 классов ферментов, каждый класс содержит подклассы, а тот — подподклассы. С помощью этой классификации каждый фермент можно записать в виде кода фермента. Этот код представляет собой сокращение КФ (EC в английском), что означает «классификация ферментов», и последовательность из 4 чисел, отделённых друг от друга точками. Первое число — класс фермента, 2-ое число — подкласс, 3-е — подподкласс, 4-ое — порядковый номер фермента. Например, запись КФ 1. 1. 1. 1 обозначает фермент, который относится к 1-ому классу, 1-ому подклассу, 1-ому подподклассу и имеет 1-ый порядковый номер. Кстати говоря, это широко известная алкогольдегидрогеназа. Хочется также отметить, что 2 разных фермента могут иметь один и тот же код! (Как вы думаете, когда такое возможно? Пишите в комментариях!) Конечно, мы не разберём всю классификацию ферментов с под- и подподклассами. Но вот классы ферментов грех не рассмотреть подробнее. 1. Оксидоредуктазы. Первый класс ферментов. Катализируют реакции переноса электронов, то есть окисление и восстановление. Представим такую ситуацию: вы переводите деньги на банковскую карточку. В нашем случае электроны — это деньги; платёжная система, с помощью которой вы осуществляете перевод, — это оксидоредуктаза. К оксидоредуктазам относятся, например, каталаза, алкогольдегидрогеназа. 2. Трансферазы. Катализируют перенос химических групп с одной молекулы на другую. Это как равноценный обмен: вы отдаёте человеку какую-то свою вещь, а он вам — свою. Я не просто так привожу такую аналогию: может возникнуть вопрос, как на деле отличить оксидоредуктазу и трансферазу. Например, трансальдолаза катализирует реакцию с изменением СО (степени окисления) атомов углерода, но при этом она относится к трансферазам. И что делать? Так вот, фактически, сразу можно проверить ОВРка (окислительно-восстановительная реакция) ли это. Если нет, то это точно трансфераза. Если ОВРка, то стоит взглянуть на саму реакцию: равноценный ли это обмен. Оксидоредуктазы катализируют реакции, где осуществляется перенос гидрид-иона, протона и других малых фрагментов молекул, в то время как трансферазы часто осуществляют «взаимовыгодный» обмен (например, обмен углеводными фрагментами). К трансферазам относится часто встречающаяся группа ферментов под названием киназы, которая затем дальше делится. Киназы занимаются переносом фосфатной группы от АТФ на другие молекулы. 3. Гидролазы. Катализируют реакции гидролиза. Всё по базе. Пришла молекула воды и сделала свою работу. Сюда относятся эстеразы, пепсин, трипсин, амилаза. 4. Лиазы. Катализируют разрыв химических связей без гидролиза с образованием двойной связи в одном из продуктов и обратные им реакции. Фактически, это такие биохимические ножницы, которые беспощадно режут всё на своём пути. Но они же могут осуществить и обратную реакцию! В случае лиаз нам стоит быть начеку: изменение СО нам обеспечено. Не забываем про образование двойной связи! Двойная связь может быть не заметной, но её надо заметить во что бы то ни стало для правильной классификации. К тому же у нас протекает разрезание молекулы либо обратная реакция, так что в идеале у нас из 1 молекулы образуется 2 либо наоборот. К лиазам относятся альдолаза, карбоксилазы, енолаза.

https://t.me/molecular_life_chat

Мы начинаем!

Биохимическая угадайка завтра в 17.00. Тема: вторичные метаболиты. Всё будет проходить в нашем чате: https://t.me/molecular_life_chat. И чтобы я понимал, сколько нас вообще будет, все, кто будет участвовать, оставьте реакцию на это сообщение. Всех жду! До завтра!

Длительность час/полтора часа

У меня тут такая идейка-предложение в основном к олимпиадникам. Хотите биохимическую угадайку веществ? Суть: я загадываю вещество, вы можете задавать любые вопросы, на которые я отвечаю "да", "нет" или "не знаю".

Ответы на цепочку!

Классный канал, всем рекомендую https://t.me/chemnanana

Как открыли инсулин? Совсем недавно у нас был пост про сахарозаменители и сахар. Сегодня поговорим про другую часть этого вопроса: инсулин, вернее, про историю его открытия. 🔬Всё началось давно. Тогда сахарный диабет встречался редко. Но если встречался, то это был смертельный приговор. В далёком 1869 году молодой студент-медик Пауль Лангерганс, рассматривая поджелудочную железу в микроскоп, обнаружил группы клеток, которые были распределены по всей железе. Их назначение, их роль тогда были не понятны. Но важно другое: человечество узнало об этих клетках (которые затем и назовут островками Лангерганса либо же Лангерганса-Соболева). ✍️Следующим важным событием в нашей истории стали работы российского учёного Соболева. Да-да, именно его фамилией называются островки поджелудочной железы. Так вот, что он, собственно, сделал? Он перевязал протоки поджелудочной железы и смотрел, что из этого выйдет. В результате основная часть железы атрофировалась, а вот островки остались целёхоньки. Сахарного диабета не было и в помине. Был сделан важный вывод: в островках поджелудочной железы содержится вещество, которое регулирует углеводный обмен. 🧪Далее в нашей истории появляется много действующих лиц, которые по всему миру пытались выделить из островков поджелудочной железы ТО САМОЕ ВЕЩЕСТВО. Определённые успехи в этих работах были. Но постоянно чего-то не хватало. 💊И тут на сцене появляются люди, у которых всё получилось. Одного из них звали Фредерик Бантинг. В детстве он потерял своего друга из-за сахарного диабета. Вообще Бантинг был хирургом, так что никак нельзя сказать, что он всю жизнь занимался выделением инсулина. Но в 1920 году Бантингу попадается в руки статья Мозеса Барона, в которой был описан клинический случай, когда протоки поджелудочной железы были закупорены камнями, но сахарный диабет не развился. И тогда нашему учёному пришла в голову идея, которую он сформулировал так: «перевязать протоки поджелудочной железы у собак. Подождать 6-8 недель. Удалить и экстрагировать». Бантинг стал воплощать свою идею в лаборатории широко известного в те времена профессора Джона Маклеода. Маклеод был не в восторге от задумки Бантинга. Он выделил в помощь Фредерику своего талантливого студента Чарльза Беста, оставил им лабораторию, а сам уехал в отпуск. В 1921 году Бантинг и Бест получили экстракт атрофированной поджелудочной железы. Экстракт ввели собаке, которая умирала от сахарного диабета. Эксперимент удался! Вскоре появились и пациенты среди людей. Так впервые в истории было получено лекарство от сахарного диабета. 👑А вместе с лекарством пришли и слава, и Нобелевка. Бантинг и Маклеод разделили Нобелевскую премию по физиологии и медицине 1923 года «за открытие инсулина». Но как же Бест? Он ведь тоже внёс вклад в открытие инсулина. Бантинг даже хотел отказаться от своей части Нобелевской премии. В итоге он её получил, но половину отдал Бесту. ⚡️Понятно, что почти сразу же промышленность заинтересовалась инсулином. Патент на инсулин был продан за 1 доллар. Да-да, за 1 доллар! Первооткрыватели отказались от коммерческой выгоды, чтобы инсулин остался доступным для всех нуждающихся. Со временем, правда, ситуация стала меняться не в лучшую сторону… #molecular_life #какэтобыло