Вирусофобия (Disease X)

https://rasls.ru/ru/blog/2026-02-19

Разработана интраназальная вакцина от актуального штамма птичьего гриппа H5N1 clade 2.3.4.4b, который сильно распространён среди животных Риск того, что два вируса заразят одну клетку, не нулевой. Именно так появляются новые внезапные сдвиги в эволюции вируса гриппа. У гриппа геном похож на бусины, и "шарики" могут поменяться местами между двумя будущими разными типами гриппа, образуя новый, третий вариант. Часто такие варианты бесперспективны и неэффективны, но если случится "удачный" вариант, то мы получим новый подтип вируса гриппа, с которым раньше не встречались. Это называют "шифт". Если "дрейф" генов (постепенные мутации из поколения в поколение) приводят в основном к подъему сезонной заболеваемости, то "шифт" - это риск эпидемий и пандемий. Именно из-за архитектурной уникальности генома гриппа ему придают такое большое внимание вирусологи и эпидемиологи. Сейчас в Штатах и в мире в целом распространяется H5N1 (преимущественно клады 2.3.4.4b), птичий грипп, который очень активно распространяется среди всех КРС, домашних животных, даже тюленей. Не надо ходить к гадалке, чтобы понять, что такое распространение вызовет множественную изменчивость, и кто знает, не случится ли страшное, и такой вирус станет обладать высокой тропностью к человеку, что свойственно его старшим братьям гриппа А (H1N1, H2N3....). Интраназальные вакцины - которые впрыскиваются в нос - теоретически должны быть лучше внутримышечных, ведь происходит имитация заражения через естественные входные ворота и слизистую. Но практика показывает обратное. Вакцины разные. Одна - белковая, словно "обломки" белков вируса, такие работают слабо. Наша слизистая встречается с таким мусором ежедневно и развивать сильный иммунный ответ на это не логично. Липосомные вакцины тоже ведут себя неоднозначно. Векторные - в основном на основе выхолощенного аденовируса шимпанзе (такие были у Астразенеки) показали сдержанную эффективность. Хотя на мышах и хомячках эти вакцины были очень эффективными. Новая векторная аденовирусная вакцина от Вашингтонского университета показала хорошие результаты на мышах и хомячках. Главное её применение - в ветеринарии, чтобы остановить распространение вируса среди животных. Тем не менее и для человека это тоже актуально. Любопытно, что если животных раньше вакцинировали от H5N1 от более старых вариантов вируса, то у них возникает перекрестный иммунитет и к новому штамму, но он низкоэффективный. Новая вакцина для таких животных вызывала выработку новых эффективных антител, "преодолевая иммунный импринтинг". #вирусы #вакцины #грипп #биотехнологии

☝️ Это пост от 2024 г., но ничего не изменилось

Геморрагическая лихорадки Нипах в Бангладеш В Бангладеш в этом году уже два человека скончались после заражения геморрагической лихорадкой Нипах (Nipah). Интересно, что оба, вероятно, заразились путем употребления сырого сока финиковой пальмы. Сок финиковой пальмы добывают примерно как у нас березовый сок – делают надрезы коры на стволе пальмы и вставляют бамбуковую трубку по которой сок собирается в емкость. Беда в том, что этот сок также очень нравиться местным фруктоядным летучим лисицам, которые являются носителями вируса Нипах. Вирус накапливается у них в слюне, моче, и .т.п. Они слетаются ночью на эти надрезы и контаминируют собранный сок. Местный минздрав постоянно предупреждает сельских жителей, чтобы не пили сырой пальмовый сок, но никто их не слушает. #нипах

В нашем канале про Нипах уже давно все написано. И про Бангладеш, и про пальмовый сок. Можно просто старые посты поднимать

Хотя ИИ пока далек от того, чтобы произвести революцию в лечении заболеваний, есть сфера, в которой он справляется гораздо лучше - и это исследования gain-of-function. Ученые из Стэнфорда обучили ИИ генерировать геномы бактериофагов, которые оказались более вирулентными, чем “дикие” штаммы. Для этого они использовали Evo и Evo 2, ИИ-модели, обученные на геномах вирусов и умеющие как прогнозировать свойства организмов, так и проектировать новые геномы. Для своего исследования ученые взяли хорошо изученный фаг ΦX174, вирус, поражающий бактерии кишечной палочки E. coli. Он прикрепляется к бактериальной клетке, вводит в нее свою ДНК, после чего бактерия начинает производить вирусы. Затем сотни новых фагов прорываются через ее оболочку и убивают ее. Исследователи предоставили ИИ фиксированный участок генома, который есть у всех штаммов ΦX174, и дали задание заполнить недостающие участки до полноценного генома. Для более реалистичного результата они обучили модели на почти 15 тыс. геномов семейства Microviridae, к которым относится ΦX174. ИИ сгенерировал тысячи геномных последовательностей, 302 из которых были признаны перспективными. Ученые смогли синтезировать в лаборатории 285 фагов и ввести их в бактерии E. coli. 16 оказались жизнеспособными: они действительно размножались и убивали клетки. Затем в рамках эксперимента ученые смешали все 16 фагов в пробирке с E. coli - что заставило их конкурировать за бактерии и позволило определить более вирулентные. Несколько сгенерированных с помощью ИИ вирусов превосходили в этом отношении “дикие” варианты, а один из них (названный Evo-Φ69) размножался на 25% быстрее. “Коктейль” из синтетических фагов также смог уничтожить 3 штамма особенно устойчивой E. coli, с которыми не мог справиться обычный ΦX174. Почему ИИ может сделать исследования gain-of-function еще более непредсказуемыми? ❇️ За счет анализа огромного объема данных он может находить закономерности там, где их не в состоянии увидеть люди. Например, Evo-Φ36 получил от ИИ “неправильный” укороченный ген J, который, по данным предыдущих исследований, приводит к нежизнеспособности фага. Но модель перестроила остальную часть генома так, чтобы эта замена сработала, и вирус стал не только функционирующим, но и более “эффективным”. Таким образом, ИИ оказался способен на нестандартный подход - но именно там, где он особенно опасен. ❇️ Эти методы позволяют создавать жизнеспособные организмы, которые не только отличаются от изначальных, но и вообще принадлежат к другим видам. Например, даже в этом эксперименте некоторые фаги имели менее 95% сходства с другими известными вирусами, что делает их представителями новых - синтетических - видов. ❇️ Авторы ИИ пытаются предпринять усилия для того, чтобы защитить модели от использования в сомнительных целях. Например, Evo и Evo 2 исключают из данных для обучения геномы человеческих вирусов. Но у этих моделей открытый код, и мотивированный специалист может обучить их самостоятельно. ❇️ От бактериофагов недалеко до других, более сложных организмов, и работа в этом отношении уже ведется, в т.ч. командой из Стэнфорда. Кроме того, сложность не обязательна для того, чтобы сделать патоген смертельно опасным. Бактериофаги были взяты в т.ч. из-за их примитивности (у ΦX174 всего 11 генов), но многие вирусы человека не намного сложнее. Так, у ВИЧ 9 генов, у вируса бешенства - 5, у флавивируса, вызывающего геморрагическую лихорадку денге - 10. Существующие сейчас методы позволяют создавать до 50 генов. ❇️ Уже в ближайшем будущем может появиться возможность генерировать геном организмов на основе заранее заданных свойств. Как заявил Брайан Хи, один из участников эксперимента, “если у вас есть совершенно новая функция, которую вы хотите сконструировать — например, заражение определенного бактериального хозяина — даже без природного аналога, я думаю, мы довольно близки к тому, чтобы это сделать”.

Сообщают, что в Индии опять несколько случаев геморрагической лихорадки Нипах в Западной Бенгалии. Это инфекция, которая переносится и передается людям от летучих лисиц (крыланов, у нас не водятся и значит природный занос исключен). Особенность данной вспышки в том, что из 5 заразившихся человек, о которых известна информация, все 5 это медсестры и врачи некой частной клиники в г. Барасат. В ней заразились сначала 2 медсестры, а потом еще медсестра и доктора. Всех перевезли в нормальную инфекционную больницу в Калькутте. И плюс более 100 чел.посадили на карантин. О лихорадке Нипах в Индии или других соседних странах часто писал здесь в канале https://t.me/virusphobia/69 Или вот, например https://t.me/virusphobia/33

5 января 2026 года на 95-том году жизни скончался наш уважаемый коллега Галегов Георгий Артемьевич. Вирусолог, доктор, биологических наук, профессор. Награжден премией Совета Министров СССР, имеет Орден «Трудового Красного Знамени» и является лауреатом Государственной премии РФ. В бывшем Институте вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН работал с 1963 года, с 1965 г по 2022 г бессменный руководитель лаборатории химиотерапии вирусных инфекций. Георгий Артемьевич – поистине классик отечественной научной школы противовирусных химиопрепаратов. Участвовал в разработке целого ряда эффективных молекул, таких как производные адамантана, рибавирин, интерфероны, различные модифицированные нуклеозиды и т.д.. Об одном из препаратов нужно отдельно сказать – фосфазид (Никавир) –отечественный препарат против ВИЧ и гепатита В, дошедший от разработки молекулы, через все необходимые до- и клинические испытания до лечения пациентов. Георгий Артемьевич принимал самое прямое участие в его разработке и внедрении, за что и стал лауреатом Государственной премии в 2000 г. Для нас, его молодых коллег, Георгий Артемьевич всегда был примером крайне доброжелательного и даже отеческого отношения и в профессиональном, и в личном плане. Я проработал с ним на одном этаже около 25 лет и, конечно, это серьезная и горькая утрата для всего вирусологического сообщества. Прощание пройдет на Хованском кладбище, большой крематорий 10 января в 12:30 Большая просьба от родственников, написать им кто пойдет на прощание и поминки.

обновлена программа https://rasls.ru/ru/blog/2025-12-15

ВИЧ, гепатиты, туберкулез, ИППП - тема очередного Совета при президиуме РАН "Науки о жизни" под руководством уважаемого академика В.П. Чехонина. Всегда рад поделиться ссылкой где можно присоединится и послушать из первых рук о состоянии этих проблем. Достаточно посмотреть на список выступающих - просто огонь! Ведущие спецы в своих темах. И есть возможность задать заранее интересующий вопрос в специальной форме 👇

https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/74/wr/mm7439a1.htm Из разряда, ничего себе как бывает. На сайте CDC опубликована статья, как мужчина после пересадки почки заболел бешенством и умер. Потому что до этого его донор был укушен скунсом и тоже умер, но от других причин.

🐱 Уганда. Молодые ученые в командировке Наши сотрудники Марат Макенов и Екатерина Обухова вылетели в Уганду для проведения совместного научного проекта по малярии. Это первые шаги в научной коллаборации, поэтому в задачи Марата и Екатерины входит: 🔴проведение переговоров с обсуждением деталей проекта; 🔴обучению работы с нашими наборами реагентов; 🔴пилотные постановки образцов от пациентов с малярией с LAMP набором и мультиплекс набором нашего производства. Несмотря на первое знакомство, совместная работа ведётся в дружной атмосфере: мы их учим работать с нашими наборами, а они нас учат местному языку Луганда Желаем Марату и Екатерине научных достижений и скорейшего возвращения!! 🐱

На сайте американского минсельхоза есть показательная обновляемая карта, с указанием диких животных, у которых уже находили высоковируслентный птичий грипп H5N1. В списке медведи, коты, еноты, скунсы, тюлени и т.д. Процесс адаптиции вируса к млекопитающим идет, а сам вирус H5N1 клады 2.3.4.4.b разделился на множество разных вариантов, которые, как правило связаны с какой-то одной экологической нишей. Но есть и хорошие новости - все эти вирусы H5N1 чувствительны к осельтамивиру и др. противогриппозным препаратам. Можно запасаться против сезонного грипп, в крайнем случае и против птичьего будет!

https://vkvideo.ru/video-30658717_456240191?t=1h20m11s&t=1h3m52s На прошлой неделе в Городе-Герое Санкт-Петербурге на самом высоком уровне прошла IV Международная конференция по вопросам противодействия инфекционным заболеваниям, организованная Роспотребнадзором. Конференция была очень плотная со множеством важных секций на самом высоком уровне, включая руководство, но я здесь делюсь с вами только секцией "Эволюция вирусов", которую поручили подготовить и провести нам с моим уважаемым коллегой, чл-корр. РАН, директором Института им. Сомова во Владивостоке Михаилом Юрьевичем Щелкановым, с чем мы, надеюсь, успешно справились. Все доклады были интересными и важными, но пользуясь правами модератора канала, даю тайминг на свой доклад (1:04:35) и также рекомендую следующий доклад уважаемой Дарьи Михайловны Даниленко из института гриппа. Ее доклад рекомендую всем кто хочет понимать, что происходит с гриппом сейчас, не только сезонным, но и с зоонозным Н5, поскольку мы здесь часто об этом упоминаем. Записи конференции опубликованы в общий доступ на VK 😉