A Certain Scientific Impostor

Уважаемые участники чата, обращаю ваше внимание на сериал «Как мы убедили коллегу разобрать Орбитрэп»: https://t.me/mass_spec_rus/1720/154125 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154160 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154162 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154244 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154245 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154246 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154247 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154248 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154249 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154250 https://t.me/mass_spec_rus/1720/154281 В главной роли уважаемый @Chai_nick Очень интересно, ждём второй сезон!

топ контент

#блестящие_железки #китайский_биотех Вот так используются в индустрии 768-канальники Richon. Отдельные чистые помещения под синтезаторы, с контролем влажности до 30%, c осушаемой и обеспыливаемой HEPA фильтрами приточкой. По три в ряд, в одном блоке по…

https://github.com/lamalab-org/openclatura Очень симпатичный опенсорс-генератор IUPAC по SMILES. Мы наверное даже попробуем в свою базу реагентики на агентах вкорячить, чтобы курировать ошибки в систематических названиях. Ребята собирают отзывы https://t.me/chempsycho/464

Щас будет наброс. Ищу практикантов ВАЙБКОДЕРОВ. Возможно, это речь про студентов старших курсов. Или нет. Мне нужен не уже готовый специалист-программист, а фанатики-дилетанты по автоматизации, желательно с хим/био бэкграундом широкого сорта (но необязательно…

Щас будет наброс. Ищу практикантов ВАЙБКОДЕРОВ. Возможно, это речь про студентов старших курсов. Или нет. Мне нужен не уже готовый специалист-программист, а фанатики-дилетанты по автоматизации, желательно с хим/био бэкграундом широкого сорта (но необязательно, достаточно фанатеть от концепции ИИ+автономная биолаба) круг задач - агрессивное использование ИИ для внедрения фичей и поддержки роя агентов на гермесе - менеджмент инфраструктуры в*нов, которая мешает государству мешать нам работать науку требуются некоторые начальные навыки администрирования линукса. понимать питон, знать слово докер. для тех кто поамбициознее - мы заинтересованы в замыкании цикла обучения с биологическим подкреплением (RLBF) на дизайнерских фагах. самое главное это ваше компульсивное желание подключить любой девайс который вы видите к ИИ агенту. лабораторные девайсы предоставим. рассматривайте как приглашение в хакспейс. мы предоставляем: - офигенные темы для дипломов и квалификационных работ - жЫрные вычислительные ресурсы (несколько серверов, несколько H100) - возможность рискованно играть в передовые инструменты на стыке ИИ и синтетической биологии - оплату токенов, подписок и систем удаленного доступа кхм для работы трудоустройство после практики обсуждаемо, неофициальная компенсация на время практики тоже. --- писать @o_fedorov или o.fedorov@sysbiomed.ru PS. мы это вот https://sysbiomed.ru/laboratories/laboratoriya-dizayna-iskusstvennykh-fermentov/

Попросили Руслана включить музыку для хроматографии. Как видно и слышно из видео, этот подход работает. Все прошло замечательно).

На текущий момент ситуация с Fable по всем интересующим меня вопросам - органика, фарма, синтетическая биология и кибербез - примерно такая: "Суверенная модель ИИ в России есть? нет? ну тогда мы решаем что ты имеешь право знать а что нет, соболезнуем мистер лох. Иди не знаю, яндекс алису спроси, или там, поплачь." Но хорошо, что антропики таким образом набивают цену человеческим специалистам.

🥂

Вот такие кремниевые вафли wafers. 1500, 4000, 19000 и 88000 олигов на чипе, от фемто до пикомоля нагрузка на спот. Декларируют синтез до 150нт в длину. Скепсис у меня определенный есть - чем плотнее расположение синтезируемых олигов, тем больше проблемы…

Вот такие кремниевые вафли wafers. 1500, 4000, 19000 и 88000 олигов на чипе, от фемто до пикомоля нагрузка на спот. Декларируют синтез до 150нт в длину. Скепсис у меня определенный есть - чем плотнее расположение синтезируемых олигов, тем больше проблемы с краевыми эффектами: в случае колоночных синтезаторов это подмесы и кросс-контаминация, в случае фотолитографических масок и фотолабильных групп - это засвет под маску, а с электрохимическими чипами это снятие защитной тритильной группы там где не надо - т.к. кислота генерируется электрохимически на споте, и соответвтенно может задеть соседние споты. Короче крайне надеюсь наложить лапки на этот девайс - это уже совсем иной уровень игры в синтетическую биологию. PS.: на минуточку, 88к олигов на чипе за раз синтезировать - это сразу бактериальный геном, небольшой. типа микоплазмы.

В рубрике #блестящие_железки сегодня вот такая зверюга. Это синтезатор олигов на электрохимическом чипе. Коллеги присматривают себе, и нам советуют, а мы и не против.

Не Китаем единым: Дмитрий Владимирович Кравченко показал нам новый цех по производству субстанции у Химрара в Химках. Делается, похоже, отчасти под развитие и отчасти - под два оригинальных препарата Химрара, в т.ч. препарат от гепатита С. Китайские реактора…

Химрар тут совместил день химика (кстати, поздравляю с прошедшим) и открытие своего нового цеха производства субстанции. Ну что сказать, по красоте все, Химрар это отдельно стоящее явление на хим/фарм ландшафте РФ. Цеха прям грамотно спроектированы, видна инженерно-химическая школа. Иващенко сказал кое-что важное - если не развивать химпром и свое производство субстанции, то через пару лет получим ситуацию "китайский автопром в фармацевтике". Как говорится, думайте, подписаться. Привет перепродаванам китайской субстанции. P.S. На символическом запуске цеха рубильником в реакторе слева включилось перемешивание и он расслоился в триколор)) зачёт.

UPD: ВАКАНСИЯ ЗАКРЫТА #вакансия #хантим Генный инженер/биотехнолог В нашу лабораторию дизайна искусственных ферментов, НИИ СБМ, Москва, требуется генный инженер с навыками работы с рекомбинантными белками (экспрессия, очистка) на проект по созданию искусственных…

Три месяца назад я написал текст этой песни   Нет, не так! Уже три года я читаю в МФТИ курс «Новости компьютерного моделирования биосистем», и вот настал момент кое-что в нем обновить. Одну лекцию я выкинул, вставив вместо нее рассказ о современных методах расчета энергий связывания в молекулярной динамике, придав этому слегка инфернальный уклон всегда ускользающей цели. А еще две — про нейросети — сильно обновил: рассказ про предсказание структур белков стал более системным и последовательным; а про белковый дизайн, надо сказать, впервые обрел необходимую четкость и теоретическую базу. Что не удивительно: в 2023 году половины того, о чем я рассказывал сегодня, еще попросту не было. Лекции доступны на ютубе и ВКонтакте: 1. Моделирование рецепторов (ВК) 2. Моделирование ионных каналов (ВК) 3. Моделирование больших и сверхбольших систем (ВК) 4. Фолдинг и взаимодействие молекул (ВК) 5. Расчеты свободных энергий связывания и улучшенное семплирование МД (ВК) 6. Новые технологии молекулярной динамики (ВК) 7. Предсказание структуры белков на базе искусственного интеллекта (ВК) 8. Белковый дизайн — технология будущего (ВК)

кстати, рекомендую: